Quatre postes (CDI) de bioinformaticiens/biostatisticiens (H/F) à l’Institut Pasteur (Paris)

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Adresse

Institut Pasteur
25 rue du Dr Roux
75724 Paris 15
France

Contacts
Christophe Malabat
Marie-Agnès Dillies
Email du/des contacts
christophe.malabat@pasteur.fr
marie-agnes.dillies@pasteur.fr
Description

 

Le Hub de Bioinformatique et Biostatistique, créé en 2015 pour apporter un support dans ces domaines aux Unités et Plateformes de l’Institut Pasteur, recrute quatre bioinformaticien·ne·s pour permettre la prise en charge des demandes croissantes en bioanalyse.

Selon les profils et les besoins, les personnes recrutées pourront être affectées pour une part de leur temps dans les Unités de recherche et/ou les Plateformes technologiques.

Missions et responsabilités:


La mission principale est d’apporter un soutien aux Unités de recherche et Plateformes pour l’analyse bioinformatique et/ou biostatistique de leurs données. Ce soutien prendra plusieurs formes : 
-    conseiller et guider dans l'utilisation de méthodes et outils d'analyse existants, 
-    maintenir une veille bibliographique active et évaluer les outils et méthodes publiés, 
-    développer lorsque nécessaire des méthodes et outils d'analyse nouveaux, 
-    analyser des données en collaboration avec les Unités et Plateformes, 
-    participer à l'élaboration et la mise en œuvre de projets collaboratifs de type ANR ou H2020, 
-    assurer le transfert d'outils et de compétences vers les Unités et Plateformes, 
-    assurer des formations en bioinformatique et biostatistiques, 
-    pérenniser et assurer le maintien des méthodes et des outils développés par les Unités, et assurer leur intégration dans des solutions logicielles de type Galaxy ou Snakemake, 
-    interagir avec le Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP, 33 instituts dans le monde entier), en particulier pour la mise en place de formations et l’analyse de données (variant calling, genome assemblies, differential analysis, etc),
-    participer à la rédaction d’articles scientifiques.

Profils de poste:

Quatre profils de poste sont proposés:


Deux postes en analyse de données  “OMICS”.

Les candidat·e·s devront satisfaire au moins deux des points suivants:
Expérience avancée dans l'analyse de toute type de données “OMICS” à grande échelle et intérêt pour l'intégration de données OMICS / multi-OMICS.
Solide connaissance des méthodes de calcul pour l'étude de l'organisation et de la régulation du génome.
Solide expérience statistique.
Expérience en analyse de réseaux (biologiques).
Expérience en analyse de données à cellule unique.
Ces deux postes seront affectés à 100% au Hub (https://research.pasteur.fr/en/team/bioinformatics-and-biostatistics-hub/).

Un poste pour la plateforme Biomics (https://research.pasteur.fr/en/team/biomics/)

Bioinformaticien avec une expérience antérieure dans l'analyse de données OMICS et le développement de pipelines. 
Maîtrise de python et expérience en développement logiciel. 
Connaissances en analyse de données de séquençage classique (appel de variantes, assemblage du génome, analyse différentielle, etc.).
Ce poste sera en double affiliation à la plateforme technologique BIOMICS (80%), et au  Hub (20%). Les candidat·e·s juniors sont encouragés à postuler sur ce profil.

Un poste pour la plateforme de métabolomique (plateforme en cours de création)

Expérience solide en (bio) statistique, y compris dans la conception expérimentale.
Expérience avérée dans l'analyse de données volumineuses; l’analyse de données OMICS et l'analyse de métadonnées sera un plus
Intérêt pour l'analyse de données multi-OMICS.
Ce poste sera en double affiliation à la plateforme de métabolomique (80%), et au  Hub (20%). Un doctorat est requis pour ce poste.


Profils des candidats et conditions:


Pour postuler il est nécessaire de justifier d’un des deux profils suivants:
-    niveau bac+5 (Master, ingénieur ou équivalent) en bioinformatique, statistiques, mathématiques appliquées ou un domaine apparenté, suivi d’une expérience professionnelle d’au moins 3 ans dans la recherche ou le soutien à la recherche en bioinformatique, biostatistiques ou analyse de données biologiques, 
-    Doctorat en bioinformatique, statistiques, mathématiques appliquées ou un domaine apparenté, suivi d’au moins 2 ans d’expérience professionnelle après la thèse dans la recherche ou le soutien à la recherche en bioinformatique, biostatistiques ou analyse de données biologiques.

Une bonne expérience en enseignement en bioinformatique/biostatistiques est un plus. 

Le Hub et l’Institut Pasteur s’engagent à promouvoir la parité, les candidatures féminines sont fortement encouragées.

Pour postuler:


Les candidatures (lettre de motivation, CV détaillé et adresses de contact de référents) sont à déposer en ligne via l’URL ci-dessous

https://c3bi.pasteur.fr/jobs/hub-2020-available-positions/hub-2020-job-application/

La date de clôture des candidatures est fixée au 02 octobre 2020. La présélection des candidat.e.s aura lieu le 02 novembre 2020. Les candidat·e·s retenu·e·s seront convoqué·e·s pour un entretien entre le 16 et le 20 novembre 2020 (dates à réserver impérativement). La prise de poste est prévue entre début janvier 2021 et mars 2021 selon les disponibilités des candidats sélectionnés.

Update:

En raison des restrictions sanitaires, des entretiens à distance seront possibles via Teams.
Un lien sera fourni. Il ne nécessitera pas l’installation du logiciel et sera accessible depuis tous les sytème d'exploitation.

 

Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe adhérente