Computational Scientist

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

20 Rue Jean Mazen
21000 Dijon
France

Contacts
thierry Billoué - DRH
Email du/des contacts
contact.rh@oncodesign.com
Description

Oncodesign Biotechnology (www.oncodesign.com) a pour mission la découverte de nouvelles molécules thérapeutiques contre les cancers et autres maladies graves sans traitement efficace connu.

OncoSNIPE® est notre programme stratégique de recherche et développement ayant pour objectif le développement d’outils de diagnostic et de recherche de nouvelles cibles thérapeutiques pour les patients résistants aux traitement anti-cancéreux. A travers OncoSNIPE®, notre ambition est d’ouvrir la voie à la médecine de précision pour vaincre le cancer.

C’est dans ce cadre qu’Oncodesign recherche pour la Business Unit Intelligence Artificielle un Data Scientist/Computational Biologist, Ingénieur ou PhD pour un poste basé à Dijon (21).

  • Quel sera votre rôle ?

Membre de l’équipe du laboratoire Data Sciences de la BU IA, vous contribuerez au succès du projet OncoSNIPE® en travaillant en étroite collaboration avec les partenaires cliniques et industriels du projet au sein d'une équipe projet transverse.

  • Quelles seront vos activités et vos champs d’expertise ?

Sans exclusive, vous serez notamment en charge de :

• L’élaboration d’une base de connaissance inscrite dans le paradigme du "knowledge graph" à partir de sources internes et externes

• De l’utilisation de cette base de connaissance afin de construire des modèles informatiques des réseaux de régulations biologiques impliqués dans divers cancers

• De l’injection des données multi-omics dans ces modèles mathématiques et informatiques afin de leur conférer un pouvoir prédictif/explicatif

• De la découverte, au moyen de simulations et de raisonnements automatisés, de nouvelles régulations biologiques pathogéniques

  • Quelles sont vos compétences ?

Votre background Bac+5/+8 en Bio-informatique ou en modélisation de systèmes complexes est complété par des connaissances en oncologie.

Vous êtes familier avec :

• RDF ou autre framework de knowledge graph modeling

• Python et/ou R • Les ontologies du domaine de la biologie (ex: Gene Ontology, BioPax, Systems Biology Ontology, ...)

• Les bases de données et de connaissances biologiques (ex: Ensembl, TCGA, Reactome, KEGG, UniProt, PubMed, BioPortal, ...)

• La modélisation et l'analyse de réseaux (ex: NetworkX, Cytoscape, iggy, ...)

• le deep learning (ex: TensorFlow, Keras, ...)

 

  • Vous êtes en phase avec le projet  et vous avez les compétences ?

Alors, franchissez le pas, et communiquez-nous votre ambition et votre envie de nous rejoindre !!! Mail : Contact.rh@oncodesign.com sous réf CS2020_08

Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe Non adhérente