Ingénieur de recherche en modélisation et statistiques multivariées

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

Route de St Cyr
78026 Versailles
France

Contacts
Fabienne Granier
Olivier Loudet
Email du/des contacts
fabienne.granier@inrae.fr
olivier.loudet@inrae.fr
Description

L'activité s'exerce à l'Institut Jean-Pierre Bourgin (INRAE Versailles), une grande unité de recherche en biologie végétale regroupant 28 équipes et 300 personnes. Vous travaillerez au sein d'un service commun de l'unité, l'équipe Bioinformatique et Informatique, en interaction avec plusieurs équipes de recherche de l'unité qui ont des projets nécessitant vos compétences. Vous devrez utiliser des outils de statistique multivariée et de modélisation pour analyser l'information contenue dans des grands jeux de données (omiques) afin de répondre aux questions des biologistes concernant les relations entre les différentes variables observées et la construction de variables explicatives et prédictives. Un comité de pilotage de l'équipe Bioinformatique et Informatique veillera à la répartition de vos capacités de travail et de formation. Les équipes de l'unité dont nous avons identifié le besoin couvrent des questions scientifiques touchant au métabolisme azoté, aux stress biotiques, au stress hydrique, à la paroi, à la variabilité génétique, à la résolution de l'équation génotype-phénotype, à la problématique des combinaisons de stress, au développement de la graine... Des compétences bioinformatiques et biostatistiques sont déjà présentes dans l'équipe Bioinformatique et Informatique, dédiée plus principalement au traitement et à l'analyse de données de séquençage massif (e.g. RNA-Seq). Des compétences en modélisation spatiale sont aussi présentes dans une autre équipe de recherche de l'unité, dédiée aux données d'imagerie. Au-delà de l'unité, nous avons déjà des collaborations avec des équipes extérieures sur ces problématiques. Vous partagerez également les tâches de gestion des données sur les serveurs que nous exploitons et devrez surtout à terme prendre le leadership de l'équipe Bioinformatique et Informatique.

Vous serez chargé-e de développer des outils et des méthodes d'analyses statistiques et de modélisation à partir de jeux de données hétérogènes issues d'analyses phénomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique et ionomique... acquises sur différents projets développés dans l'unité, ainsi que des modèles structure-fonction. Vous devrez être en mesure de transférer ces outils et ces méthodes auprès des équipes de l'unité et de former les utilisateurs.

Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe Non adhérente