INGENIEUR DE RECHERCHE (H/F) PLATEFORME BIOINFORMATIQUE

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

24 boulevard du Montparnasse
75015 PARIS
France

Contacts
Recrutement
Email du/des contacts
recrutement@institutimagine.org
Description

Créé à l’initiative des chercheurs et médecins de l’Hôpital Necker – Enfants malades, l’Institut Imagine, labélisé Institut Hospitalo-Universitaire (IHU) et Institut Carnot, développe des programmes scientifiques fondés sur une continuité entre recherche fondamentale, recherche clinique et soins innovants sur les maladies génétiques, de l’enfance à l’âge adulte. Imagine a pour ambition d’accélérer la recherche en l’organisant au plus près du malade afin d’apporter les solutions diagnostiques et thérapeutiques tant attendues par les patients et leurs familles.

Au sein de l’Institut, les activités de la plateforme de bioinformatique Paris Descartes (BIPD) recouvrent essentiellement :
- les traitements et analyses des données de reséquençage, exomes, génomes, panels ciblés, RNA-seq et Chip-seq, les études fonctionnelles « in silico » des voix métaboliques (Ingenuity)
- les analyses statistiques d'association génétique sur les données de séquençage (burden test).

La plateforme accompagne les scientifiques de l’Institut dans toutes les étapes de leurs projets : aide au design des expériences, traitement et analyse des données, développement de pipelines et accès aux outils bioinformatiques pour l’intégration des données et leur interprétation.

Dans l’optique d’accroitre son expertise et sa visibilité dans le domaine des analyses RNA-seq, l’Institut Imagine recherche un ingénieur de recherche expérimenté pour renforcer l’équipe et développer le pôle transcriptomique de la plateforme.

MISSIONS ET FONCTIONS

Sous la responsabilité du responsable de la plateforme, et en collaboration avec un autre ingénieur, l’ingénieur de recherche assurera la conduite de projets, depuis le conseil au plan expérimental, jusqu’à l'analyse et l'interprétation biologique.

Il aura pour missions :

- proposer des solutions innovantes, en phase avec les évolutions technologiques et mettre en place la production de rapports de résultats adaptés aux demandes des porteurs de projet ;
- participer au développement d’une solution permettant d’intégrer et exploiter au sein d’un même projet des données issues de différents types d’analyse, RNA-seq, exomes, génomes complets ;
- assurer le développement de l’activité RNA-seq et contribuer à accroitre la visibilité de la plateforme dans ce domaine par des présentations, des formations et l’animation d’un réseau de collaborateurs.

COMPETENCES

- Bonne pratique de l’anglais à l’écrit et à l’oral ;
- Connaissance et maîtrise de l’écriture de scripts (perl, bash, R) en environnement Linux et pour l’utilisation de clusters de calculs ;
- Connaissances des mécanismes moléculaires fondamentaux impliqués dans les maladies humaines et plus particulièrement dans les maladies génétiques ;

QUALITES

- Rigueur, organisation, autonomie et polyvalence ;
- Sens du collectif et du travail en équipe ;
- Sens du service ;
- Sens de la communication ;
- Savoir évoluer au sein d’un environnement complexe et exigeant.

DIPLOME ET EXPERIENCE

- PhD, de préférence dans les domaines de la bioinformatique ;
- Expérience significative dans le domaine du RNA-seq.

NATURE DU POSTE

- CDI ;
- Prise de fonction dès que possible ;
- Localisation : Institut Imagine - 24 boulevard du Montparnasse 75015 PARIS ;
- Salaire selon profil et expérience.

MODALITES DU RECRUTEMENT

Le dossier de candidature, comprenant une lettre de motivation et un curriculum vitae détaillé, est à adresser, sous la référence Imagine_182.

Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe Non adhérente