M2 - BioInformatique et Biologie Computationnelle (H/F)

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

125, chemin de Ronde
78290 CROISSY-SUR-SEINE
France

Contacts
DAVIAUD Stéphanie
Email du/des contacts
stephanie.daviaud@servier.com
Description

Au sein de l'équipe de Bioinformatique, vous aurez en charge l'examen et la sélection d’outils d’identification de type de cellule pour l’analyse des données RNAseq à cellule unique, et l'intégration des outils sélectionnés pour adapter l’analyse de la base de données à cellule unique.

Missions :
- Examen des outils d’identification de type de cellule existants pour les données RNAseq à cellule unique
- Faire un benchmark des outils avec la base de données RNAseq à cellule unique publique des types de cellules connus
- Sélection d’outils en fonction des critères suivants : a) applicables à différents types d’ensemble de données à cellule unique (10X, smartSeq, ...); b) haute performance, avec une haute précision d’identification de type cellulaire; c) ergonomique / facilité d’implémentation (R, python préféré)
- Implémentation des outils sélectionnés
- Implémentation des outils sélectionnés

Profil recherché :
Formation : idéalement Master 2 Bioinformatique ou Biostatistiques
Compétences : Bonne connaissance de l’analyse des données RNAseq à cellule unique et de la méthode d’apprentissage automatique; Connaissance de la biologie et des statistiques
Personne autonome, sérieuse, motivée et avec un bon esprit d'équipe
Expériences : la familiarité avec l'environnement Linux, R et Python est obligatoire

Date début de stage : janvier 2021

Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe Non adhérente