Stage en bioinformatique / analyse de signal

Descriptif de la mission

Dans le cadre des travaux d’exploration de la biodiversité bactérienne menés à DEINOVE, nous développons des méthodes robotisées innovantes pour la caractérisation rapide des souches. Un signal spécifique est ainsi associé à chaque souche bactérienne. La mission qui sera confiée au stagiaire sera de travailler sur le développement et l’application de nouvelles méthodes pour traiter les signaux produits, notamment en faisant appel à de l’apprentissage automatique. Les objectifs sont les suivants :

• Améliorer les seuils de détection
• Améliorer la robustesse de l’approche lorsque la qualité des signaux est dégradée
• Filtrer automatiquement les signaux présentant des problèmes techniques

Formation et compétences

Le stagiaire est en dernière année de cycle d’ingénieur, ou en master 2 avec une spécialisation en bioinformatique, biomathématiques ou mathématiques appliquées, et doit avoir les compétences suivantes :

• Esprit d’analyse, curiosité, créativité, inventivité,
• Bonne maîtrise de l’outil R et du langage python,
• Connaissances en traitement de signal,
• Connaissances en analyse de donnée & machine learning,
• Notions en biologie moléculaire.

Conditions

• Indemnité de stage mensuelle basée sur le barème légal annuel
• Titres restaurant
• Prise en charge des frais de transport en commun à hauteur de 50%