Stage en bioinformatique / analyse de signal

Type de poste
Niveau d'étude minimal
Dates
Durée du poste
Contrat renouvelable
Contrat non renouvelable
Date de prise de fonction
Date de fin de validité de l'annonce
Localisation
Nom de la structure d'accueil
Adresse

CAP SIGMA, ZAC Euromédecine II 1682 rue de la Valsière
1682 rue de la Valsière
34790 Grabels
France

Contacts
Guillaume Letellier
Email du/des contacts
Guillaume.letellier@DEINOVE.com
Description

Descriptif de la mission

Dans le cadre des travaux d’exploration de la biodiversité bactérienne menés à DEINOVE, nous développons des méthodes robotisées innovantes pour la caractérisation rapide des souches. Un signal spécifique est ainsi associé à chaque souche bactérienne. La mission qui sera confiée au stagiaire sera de travailler sur le développement et l’application de nouvelles méthodes pour traiter les signaux produits, notamment en faisant appel à de l’apprentissage automatique. Les objectifs sont les suivants :

  • Améliorer les seuils de détection
  • Améliorer la robustesse de l’approche lorsque la qualité des signaux est dégradée
  • Filtrer automatiquement les signaux présentant des problèmes techniques

Formation et compétences

Le stagiaire est en dernière année de cycle d’ingénieur, ou en master 2 avec une spécialisation en bioinformatique, biomathématiques ou mathématiques appliquées, et doit avoir les compétences suivantes :

  • Esprit d’analyse, curiosité, créativité, inventivité,
  • Bonne maîtrise de l’outil R et du langage python,
  • Connaissances en traitement de signal,
  • Connaissances en analyse de donnée & machine learning,
  • Notions en biologie moléculaire.

Conditions

  • Indemnité de stage mensuelle basée sur le barème légal annuel
  • Titres restaurant
  • Prise en charge des frais de transport en commun à hauteur de 50%
Equipe adhérente personne morale SFBI
Equipe Non adhérente