CNRS

Comparaison de modeles en phylogéographie

L'analyse de séquences génétiques géo-référencées permet d'avancer dans notre compréhension de la
biodiversité et de son évolution dans le temps et l'espace. Cependant, les méthodes et modèles
probabilistes utilisés ici sont souvent complexes et les résultats obtenus parfois difficiles
à interpréter. Par ailleurs, les hypothèses sous-jacentes ne sont pas systématiquement
transposables de l'une à l'autre de ces méthodes et le sens des paramètres inférés est
parfois ambiguë.

Third generation sequencing to investigate a novel type of RNA regulation.

Intron retention (IR) occurs when an intron is included in a mature mRNA. Previously regarded as a byproduct of faulty splicing, transcripts with retained introns are often rapidly degraded by a surveillance mechanism called nonsense-mediated decay (NMD). Our team discovered that numerous cell types make use of this mechanism by increasing the amount of transcripts with retained introns for degradation in blood cells (Cell, 2013) and in pluripotent stem cells (Nature, 2014). IR was also recently found to modulate tumour suppressor genes in many different cancers (Nature Genetics, 2015).