Université Paris-Sud, laboratoire Ecologie Systematique Evolution UMR8079

Gestion des premières étapes d’analyses de génomes entiers

Bonjour,
Dans le cadre d’un projet ANR JCJC sur l’adaptation parallèle des champignons au fromage, nous recrutons un-e ingénieur-e d’étude en bioinformatique (niveau Master, bac+5) au sein du laboratoire Ecologie Systématique et Evolution de l’université Paris-Saclay à Orsay (équipe Génétique et écologie évolutives). L’ingénieur-e aura pour mission de gérer les premières étapes d’analyses de génomes entiers :

(Epi)genomics of protists

==== Project overview ====

The candidate will work in the context of the ERC Starting Grant Macro-EpiK, which aims, among others, at better understanding the diversity and evolution of epigenetic modifications in eukaryotic microbes (protists).

During his/her PhD, the candidate will take part in 1) preparing genetic material (RNA and DNA) for transcriptome, genome and methylome sequencing, and 2) their subsequent assembly, annotation and various other bioinformatic investigations.

Adaptation parallèle des champignons au fromage / Parallel adaptation in cheese fungi

FRENCH - Une des questions majeures de biologie évolutive est de déterminer si l’évolution est répétable ou contingente. Les études d’adaptations parallèles, c’est-à-dire d’évènements indépendants d’adaptation à la même niche écologique, sont nécessaires pour déterminer la répétabilité de l’évolution. Les champignons du fromage sont d’excellents modèles pour ce genre d’études car plusieurs espèces ont été sélectionnées par l’Homme pour affiner les fromages.