MIAT

Algorithmes d’assemblage de génomes complexes

La disponibilité de nouvelles technologies de séquençage de longs fragments a ouvert de nouveaux horizons dans le domaine de l’analyse des génomes en permettant par exemple l’assemblage de novo de différents individus, et l’étude de la diversité de leurs génomes sans baser l’analyse sur un génome de référence potentiellement éloigné des individus à l’étude et donc présentant le risque de biaiser l’analyse.

CDD en bio-statistique de 12 mois

Dans le cadre du projet ANR CASPAR, dont l'objectif est de décrypter le rôle physiologique de deux ribonucléases majeures conservées chez les Archées, il s'agira pour la personne recrutée de réaliser le traitement des données de séquençage qui seront produites au cours du projet :

- Analyse différentielle de gènes à partir de données RNAseq ;

- Identification des partenaires ARN des protéines étudiées à partir de données RIP-seq.