Stage

DNA topology (or supercoiling) is a fundamental mechanism of compaction of the bacterial chromosome. The student will analyze and model the mechanisms by which it plays a role as a global and multi-scale transcriptional regulator. In contrast to usual regulation mechanisms based on transcription factors which target specific genes, DNA topology influences gene expression in a global, non-specific manner in a wide range of species.

Le génome de chaque espèce est unique mais l’organisation spatiale des génomes dans le noyau des cellules eucaryotes semble être régie par des règles similaires. Les longues molécules d'ADN qui constituent les chromosomes doivent être fortement compactées pour tenir dans le noyau. Toutefois, il n'est pas question de replier les chromosomes au hasard! Des compartiments génomiques se forment alors séparant les régions contenant les gènes actifs des régions inactives.

SANOFI a pour ambition d'être un Leader Mondial et intégré de la Santé, centré sur les besoins des patients.
Rejoignez SANOFI et prenez part à notre ambition : protéger la santé, apporter l'espoir et améliorer la qualité de vie des sept milliards de personnes dans le monde.
Grâce à un environnement dynamique et diversifié, nous vous offrons des opportunités de développer vos compétences, réaliser vos objectifs et apporter votre contribution à des innovations capitales en matière de santé.

Title:
Integration of network information and gene expression data.

Le stage consiste à dénombrer les captures d'abeilles par des frelons asiatiques à partir des méthodes de traitement automatique de détection d’objets dans des vidéos à base de Réseaux de Neurones Profonds pour alléger le travail des opérateurs tout en fiabilisant les comptages. L’étudiant.e travaillera à partir de vidéos de 1920x1080 pixels acquises à une fréquence de 25 images / seconde (voir image ci-jointe). Il / elle abordera les points suivants :

Contexte / Problématique :

Développement d'un pipeline pour l'interprétation de données de génétique spécifiques à la pharmacologie des opioïdes, intégrant le recours à des outils en ligne et des outils disponibles au laboratoire développés sous Python3.
Autonomie complète pour le choix de l'approche bioinformatique.
Synergie avec les biologistes impliqués dans les projets de recherche en cours.

SANOFI a pour ambition d'être un Leader Mondial et intégré de la Santé, centré sur les besoins des patients.
Rejoignez SANOFI et prenez part à notre ambition : protéger la santé, apporter l'espoir et améliorer la qualité de vie des sept milliards de personnes dans le monde.
Grâce à un environnement dynamique et diversifié, nous vous offrons des opportunités de développer vos compétences, réaliser vos objectifs et apporter votre contribution à des innovations capitales en matière de santé.

Dans ce contexte, Sanofi Recherche et Développement recherche :

Ce stage a pour objectif de tester les potentialités de l’analyse d’une série temporelle
d’images RGB pour quantifier la phénologie du manguier (dénombrement dans le temps des pousses
végétatives, des inflorescences, des mangues vertes, et des mangues matures). Ces analyses permettront
à terme de caractériser la distribution temporelle des stades phénologiques et d’étudier le lien entre les
stades phénologique à l’échelle de l’arbre (les arbres aux floraisons plus étalées produisent-ils plus de
fruit ? et ces productions sont-elles aussi plus étalées ?)

Sanofi Pasteur, Division Vaccins du Groupe SANOFI, est la plus grande société dans le monde entièrement dédiée aux vaccins humains, avec la plus large gamme de produits en portefeuille et en développement. Sa vocation est de protéger les personnes contre les maladies infectieuses en créant des vaccins sûrs et efficaces.