DSIMB-UMR-S1134

IGE en Bionformatique Structurale et Modélisation Moléculaire

Le Laboratoire DSIMB travaille sur des protéines impliquées dans des infections bactériennes et liées à des mécanismes de résistance aux antibiotiques. Ces protéines MexA,MexB et OprM ou MexE, MexF et OprN, s’assemblent pour former des pompes à efflux qui vont ensemble extruder l’antibiotique. L’équipe effectue l’analyse fine des différentes structures protéiques constituant la pompe, et vise à prédire la structure du complexe.

IGE en Bionformatique Structurale et Modélisation Moléculaire

Le Laboratoire DSIMB travaille sur des protéines impliquées dans des infections bactériennes et liées à des mécanismes de résistance aux antibiotiques. Ces protéines MexA,MexB et OprM ou MexE, MexF et OprN, s’assemblent pour former des pompes à efflux qui vont ensemble extruder l’antibiotique. L’équipe effectue l’analyse fine des différentes structures protéiques constituant la pompe, et vise à prédire la structure du complexe.

chef de projet en Bionformatique Structurale et Modélisation Moléculaire

L’ingénieur de Recherches (IGR) en Bionformatique et Modélisation Moléculaire rejoint l’équipe DSIMB le temps du projet afin d’assurer :

Prédiction et modélisation des assemblages MexA/MexB/OprM et MexE/MexF/OprN.

En partenariat avec deux IGE, il/elle explore la flexibilité des protéines et identifie les résidus clés de leur dynamique. Il/Elle met en place les stratégies pour prédire l’interaction entre partenaires par des approches de docking couplées à des simulations gros-grains afin de proposer des modèles d’assemblages

Développements Méthodologiques :