6 mois

M2 recherche

Contexte scientifique et projet :

Chaque tissu est composé de différents types cellulaires. L’équilibre de sa composition est soumis à régulation assurant ainsi un fonctionnement optimal. Un type cellulaire donné est caractérisé par un certain niveau de variabilité ou plasticité intrinsèque, également fortement contrôlé. Récemment, de nombreuses études ont démontré le rôle crucial joué par ces différents niveaux d’hétérogénéité intra-tumorale sur l’initiation, le développement et la virulence du cancer.

Développeur full-stack - Start-up iMEAN

Informations générales sur l’entreprise :

iMEAN est une jeune start-up de bio-informatique fournissant des services d’analyses in silico pour les entreprises de biotechnologies et pour la recherche académique. Notre technologie principale est la modélisation mathématique des organismes vivants. Dans le cadre de nos activités, nous développons des outils logiciels internes pour aider nos collaborateurs dans la création de modèles et l’analyse de données.

Description du stage :

M2 - Détection de variants structuraux par assemblage de génome de novo chez l’abricotier et le chêne blanc

Nous proposons un stage de M2 centré sur la détection de variants par assemblage de génome de novo. Ce stage s’inscrit dans le cadre d’une collaboration entre l’UMR BIOGECO (https://www6.bordeaux-aquitaine.inra.fr/biogeco) et l’UMR BFP (https://www6.bordeaux-aquitaine.inrae.fr/bfp).

Informations générales
Dates du stage: 1er semestre 2021

M2 - Utilisation des réseaux antagonistes génératifs pour manipuler des images de signaux sexuels animaux

STAGE de Master 2 – Césure
Utilisation des réseaux antagonistes génératifs pour manipuler des images de signaux sexuels animaux

MONTPELLIER

Responsables
• Julien Renoult (julien.renoult@cefe.cnrs.fr), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE ; UMR5175), Montpellier
• William Puech (william.puech@lirmm.fr), Laboratoire d’Informatique, de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM ; UMR5506), Montpellier

Characterization and comparison of the eukaryotic virome and of endogenous retroviruses in whole blood RNAseq data of healthy volunteers and patients affected by autoimmune diseases

Autoimmune and autoinflammatory diseases are characterized respectively by an adaptive immune response to self-antigens and by an inflammation without specific recognition of self-antigens. Many diseases present with a mixed spectrum of autoimmune and autoinflammatory components. The Transimmunom study has the goal to better classify diseases within this spectrum and to identify new biomarkers and immunological mechanisms by recruiting patients of 19 diseases within this spectrum as well as healthy controls.

Bioinformatics R&D

Scipio bioscience is a biotechnology company incubated at the iPEPS of the Brain Institute of Paris. We offer an innovative single-cell RNA-seq technology based on a combination of proven biochemical and biophysical approaches. In kit form, this solution allows the preparation of samples for single cell studies, which can be used in sequencing applications in fundamental and clinical research, in particular transcriptomics. We are currently in the development phase of both the kit and related software.