Thèses et Habilitation à Diriger des Recherches

Nom Prénom Année Diplôme Title Université
Calzone Laurence 2019 HDR Cancer Network Modelling: towards precision medicine Ecole Normale Supérieure
Sultan Ibrahim 2019 Thèse Statistical Modeling of Bacterial Promoter Sequences for Regulatory Motif Discovery Université Paris-Saclay
Hernandez Céline 2019 Thèse Dynamical modelling of T cell inhibitory mechanisms in the immune response to cancer Ecole Normale Supérieure de Paris
Ferré Arnaud 2019 Thèse Représentations vectorielles et apprentissage automatique pour l’alignement d’entités textuelles et de concepts d’ontologie : application à la biologie Université Paris-Saclay
De Boër Jocelyn 2019 Thèse Indexation et comparaison d’une grande quantité de données génomiques à l’aide d’algorithmes pour le traitement d’images Université de Dlermont-Ferrand
Michalik Juraj 2019 Thèse Echantillonage sans remise en Bioinformatique des Acides RiboNucléiques Ecole Polytechnique
Platon Ludovic 2019 Thèse Algorithmes pour l'identification et la classification ab initio des ARN non-codants Université d'Evry Val d'Essonne
Jouffroy Ophélie 2018 Thèse Approches in silico de l'impact des éléments transposables sur la régulation de l'expression des gènes AgroParisTech
Plaza Oñate Florian 2018 Thèse Reconstitution de pan-génomes microbiens par séquençage métagénomique aléatoire - Application à l'étude du microbiote intestinal humain CentraleSupelec
Miraglio Benjamin 2018 Thèse Modélisation informatique pour l'évaluation toxicologique
Razzaq Misbah 2018 Thèse Intégration de données de séries temporelles phosphoprotéomiques dans des réseaux de connaissances antérieurs Ecole Centrale
Nicolas Pierre 2018 HDR Modélisation statistique et analyse de données, du génome au transcriptome Université Paris-Saclay
Laporte Fabien 2018 Thèse Développement de méthodes statistiques pour l’identification de gènes d’intérêt en présence d’apparentement et de dominance, application à la génétique du maïs Université Paris-Saclay ; EDMH
BESSIERE Chloé 2018 Thèse Étude des éléments régulateurs de l’expression des gènes chez l’humain Universite de Montpellier
Frioux Clémence 2018 Thèse Investigating host-microbiota cooperation with gap-filling optimization problems Université de Rennes
Maumus Florian 2018 HDR Evolution and Impact of Transposable Elements and Viruses Université Paris-Saclay
Villa Francesco 2018 Thèse Computer simulations to engineer PDZ-peptide recognition Ecole Polytechnique
Baudot Anaïs 2018 HDR biologie des réseaux pour l’étude des maladies Université de Marseille
Marchet Camille 2018 Thèse From reads to transcripts: de novo methods for the analysis of transcriptome second and third generation sequencing Université de Rennes
ZAHARIA Alexandra 2018 Thèse Identification des motifs de voisinage conservés dans des contextes métaboliques et génomiques Université Paris-Saclay
Collombet Samuel 2017 Thèse Deciphering the regulatory network controlling blood cells specification and reprogramming
Jain Sourabh 2017 Thèse Comparative genomics study for identification of gene acquisitions in Megavirales Aix-Marseille Université
BROHARD Solène 2017 Thèse Tissue expression of paralogous genes: application on the human brain and its pathological state Université d'Evry Val d'Essonne
Mary-Huard Tristan 2017 HDR Some contributions to statistical modeling and model selection, with applications to genomics and quantitative genetics
ABOU-KHATER Charbel 2017 Thèse Caractérisation de nouveaux gènes et polymorphismes potentiellement impliqués dans les interactions hôtes-pathogènes Aix-Marseille Université
Sadacca Benjamin 2017 Thèse Pharmacogenomic and high-throughput data analysis to overcome triple negative breast cancers drug resistance Université non communiquée
Vannier Thomas 2017 Thèse Dynamique de la structure des génomes et de leur biogéographie dans l'océan : analyses comparatives des données métagénomiques du projet tara Oceans pour l'étude de la microalgue Bathycoccus et des communautés planctoniques globales
CHABROL Olivier 2017 Thèse Modèles et Algorithmes pour l’évolution biologique Université de Marseille
VALSAMOU Dialekti 2017 Thèse Extraction d'information à partir d'articles scientifiques appliquée à la prédiction de régulations biologiques impliquées dans le développement de la graine chez A. Thaliana Université Paris-Saclay
Héliou Alice 2017 Thèse Analyse des séquences génomiques : Identification des ARNs circulaires et calcul de l'information négative
Aubert Julie 2017 Thèse Analyses statistiques de données biologiques à haut-débit AgroParisTech
Héliou Amélie 2017 Thèse Conformations moléculaire et théorie des jeux
REMY Élisabeth 2017 HDR Modélisation logique pour l’analyse des réseaux de régulation biologiques Aix-Marseille Université
Rudewicz Justine 2017 Thèse Méthodes bioinformatiques pour l'analyse de données de séquençage dans le contexte du cancer Université de Bordeaux
Martin Juliette 2017 HDR Bioinformatique Structurale des Interactions Protéine-Protéine ENS Lyon
RAU Andrea 2017 HDR Statistical methods and software for the analysis of transcriptomic data Université d’Evry-Val-d’Essonne
Mercier Jonathan 2017 Thèse Logique paracohérente pour l’annotation fonctionnelle des génomes au travers de réseaux biologiques Genoscope, Evry
Cornillon Emilien 2017 Thèse Modèles qualitatifs de réseaux génétiques : réduction de modèles et introduction d’un temps continu.
Chen Chunlong 2017 HDR Le programme spatio-temporel de réplication et son impact sur la stabilité du génome Institut Curie
Panel Nicolas 2017 Thèse Étude computationnelle du domaine PDZ de Tiam1
Empereur-mot Charly 2017 Thèse Développement d'outils statistiques d'évaluation de méthodes de criblage virtuel : courbes de prédictivité & Screening Explorer CNAM
Nassar Elma 2016 Thèse Modèles Probabilistes de l'Evolution d'une Population dans un Environnement Variable Aix-Marseille Université
DRUART Karen 2016 Thèse Défis algorithmiques pour les simulations biomoléculaires et la conception de protéines CEA Saclay, École Polytechnique
Salle Sandrine 2016 Thèse Evolution des génomes chez les bactéries du super-phylum Planctomycetes-Verrucomicrobiae-Chlamydia Aix-Marseille
CONTRI Benjamin 2016 Thèse Equations de réaction-diffusion dans un environnement périodique en temps - Applications en médecine Aix-Marseille Université
Fumey Julien 2016 Thèse Tempo et mode de l'évolution des populations cavernicoles de l'espèce Astyanax mexicanus Université Paris-sud
DAMERON Olivier 2016 HDR Ontology-based methods for analyzing life science data IRISA, Rennes
Schwaller Loïc 2016 Thèse Exact Bayesian Inference in Graphical Models: Tree-structured Network Inference and Segmentation Agro Paris Tech
Durif Ghislain 2016 Thèse Statistique multivariée pour l'analyse de données de séquençage à haut débit Université Lyon 1
Peterlongo Pierre 2016 HDR Lire les lectures : analyse de données de séquençage IRISA, Rennes