| Bidaut |
Ghislain |
2020 |
HDR |
Approches d'intégration de données haut débit dans l'interactome humain |
Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille, U1068 Inserm |
| Gautreau |
Guillaume |
2020 |
Thèse |
Conceptualisation et exploitation d’un graphe de pangénome partitionné comme représentation compacte de la diversité du répertoire génique des espèces procaryotes |
CEA - GENOSCOPE |
| Meistermann |
Dimitri |
2020 |
Thèse |
Modélisation du développement préimplantatoire humain à partir de données de transcriptome de cellule unique |
CNRS UMR 6286, université de Nantes |
| David |
Matthieu |
2019 |
Thèse |
Découverte de modifications chimiques portées par les protéines : identification rapide de jeux de spectres de masse sans filtre de masse |
CNRS UMR 6286, université de Nantes |
| Sultan |
Ibrahim |
2019 |
Thèse |
Statistical Modeling of Bacterial Promoter Sequences for Regulatory Motif Discovery |
Université Paris-Saclay |
| Pauvert |
Charlie |
2019 |
Thèse |
Comparaison et évaluation d’approches bioinformatiques et statistiques pour l’analyse du pathobiome des plantes cultivées |
Université de Bordeaux |
| Hernandez |
Céline |
2019 |
Thèse |
Dynamical modelling of T cell inhibitory mechanisms in the immune response to cancer |
Ecole Normale Supérieure de Paris |
| Koch |
Mathilde |
2019 |
Thèse |
Modélisation pour la conception et l’analyse de circuits métaboliques synthétiques |
MICALIS - INRA Jouy en Josas |
| Ferré |
Arnaud |
2019 |
Thèse |
Représentations vectorielles et apprentissage automatique pour l’alignement d’entités textuelles et de concepts d’ontologie : application à la biologie |
Université Paris-Saclay |
| Gautier |
Romain |
2019 |
HDR |
L'apport de la bio-informatique structurale dans la biologie moléculaire des membranes |
UMR7275 Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire Univ Nice Sophia Antipolis |
| De Boër |
Jocelyn |
2019 |
Thèse |
Indexation et comparaison d’une grande quantité de données génomiques à l’aide d’algorithmes pour le traitement d’images |
Université de Dlermont-Ferrand |
| Peres |
Sabine |
2019 |
HDR |
Metabolic pathway analysis : from constraint-based modelling to dynamical analysis |
LRI |
| Michalik |
Juraj |
2019 |
Thèse |
Echantillonage sans remise en Bioinformatique des Acides RiboNucléiques |
Ecole Polytechnique |
| Koch |
Mathilde |
2019 |
Thèse |
Modélisation pour la conception et l’analyse de circuits métaboliques synthétiques |
MICALIS - INRA Jouy en Josas |
| Platon |
Ludovic |
2019 |
Thèse |
Algorithmes pour l'identification et la classification ab initio des ARN non-codants |
Université d'Evry Val d'Essonne |
| Legendre |
Audrey |
2019 |
Thèse |
Prédiction de structures secondaires d’ARN et de complexes d’ARN avec pseudonoeuds - Approches basées sur la programmation mathématique multi-objectif |
Université d'Evry Val d'Essonne |
| Coulet |
Adrien |
2019 |
HDR |
Mises en correspondances de données, textes et connaissances pour la découverte de connaissances biomédicales |
CNRS, LORIA |
| Chèneby |
Jeanne |
2019 |
Thèse |
Etude des éléments cis-régulateurs : identification et caractérisation |
Aix Marseille Université |
| Trébulle |
Pauline |
2019 |
Thèse |
Modélisation multi-échelles de réseaux biologiques pour l'ingénierie métabolique d'un châssis biotechnologique |
MICALIS, Université de Lille |
| Calzone |
Laurence |
2019 |
HDR |
Cancer Network Modelling: towards precision medicine |
Ecole Normale Supérieure |
| Frioux |
Clémence |
2018 |
Thèse |
Investigating host-microbiota cooperation with gap-filling optimization problems |
Université de Rennes |
| Maumus |
Florian |
2018 |
HDR |
Evolution and Impact of Transposable Elements and Viruses |
Université Paris-Saclay |
| Villa |
Francesco |
2018 |
Thèse |
Computer simulations to engineer PDZ-peptide recognition |
Ecole Polytechnique |
| Baudot |
Anaïs |
2018 |
HDR |
biologie des réseaux pour l’étude des maladies |
Université de Marseille |
| Marchet |
Camille |
2018 |
Thèse |
From reads to transcripts: de novo methods for the analysis of transcriptome second and third generation sequencing |
Université de Rennes |
| ZAHARIA |
Alexandra |
2018 |
Thèse |
Identification des motifs de voisinage conservés dans des contextes métaboliques et génomiques |
Université Paris-Saclay |
| Jouffroy |
Ophélie |
2018 |
Thèse |
Approches in silico de l'impact des éléments transposables sur la régulation de l'expression des gènes |
AgroParisTech |
| Plaza Oñate |
Florian |
2018 |
Thèse |
Reconstitution de pan-génomes microbiens par séquençage métagénomique aléatoire - Application à l'étude du microbiote intestinal humain |
CentraleSupelec |
| Miraglio |
Benjamin |
2018 |
Thèse |
Modélisation informatique pour l'évaluation toxicologique |
|
| Razzaq |
Misbah |
2018 |
Thèse |
Intégration de données de séries temporelles phosphoprotéomiques dans des réseaux de connaissances antérieurs |
Ecole Centrale |
| Nicolas |
Pierre |
2018 |
HDR |
Modélisation statistique et analyse de données, du génome au transcriptome |
Université Paris-Saclay |
| Laporte |
Fabien |
2018 |
Thèse |
Développement de méthodes statistiques pour l’identification de gènes d’intérêt en présence d’apparentement et de dominance, application à la génétique du maïs |
Université Paris-Saclay ; EDMH |
| BESSIERE |
Chloé |
2018 |
Thèse |
Étude des éléments régulateurs de l’expression des gènes chez l’humain |
Universite de Montpellier |
| Héliou |
Alice |
2017 |
Thèse |
Analyse des séquences génomiques : Identification des ARNs circulaires et calcul de l'information négative |
|
| Aubert |
Julie |
2017 |
Thèse |
Analyses statistiques de données biologiques à haut-débit |
AgroParisTech |
| Héliou |
Amélie |
2017 |
Thèse |
Conformations moléculaire et théorie des jeux |
|
| REMY |
Élisabeth |
2017 |
HDR |
Modélisation logique pour l’analyse des réseaux de régulation biologiques |
Aix-Marseille Université |
| Rudewicz |
Justine |
2017 |
Thèse |
Méthodes bioinformatiques pour l'analyse de données de séquençage dans le contexte du cancer |
Université de Bordeaux |
| Martin |
Juliette |
2017 |
HDR |
Bioinformatique Structurale des Interactions Protéine-Protéine |
ENS Lyon |
| RAU |
Andrea |
2017 |
HDR |
Statistical methods and software for the analysis of transcriptomic data |
Université d’Evry-Val-d’Essonne |
| Mercier |
Jonathan |
2017 |
Thèse |
Logique paracohérente pour l’annotation fonctionnelle des génomes au travers de réseaux biologiques |
Genoscope, Evry |
| Cornillon |
Emilien |
2017 |
Thèse |
Modèles qualitatifs de réseaux génétiques : réduction de modèles et introduction d’un temps continu. |
|
| Chen |
Chunlong |
2017 |
HDR |
Le programme spatio-temporel de réplication et son impact sur la stabilité du génome |
Institut Curie |
| Panel |
Nicolas |
2017 |
Thèse |
Étude computationnelle du domaine PDZ de Tiam1 |
|
| Empereur-mot |
Charly |
2017 |
Thèse |
Développement d'outils statistiques d'évaluation de méthodes de criblage virtuel : courbes de prédictivité & Screening Explorer |
CNAM |
| Collombet |
Samuel |
2017 |
Thèse |
Deciphering the regulatory network controlling blood cells specification and reprogramming |
|
| Jain |
Sourabh |
2017 |
Thèse |
Comparative genomics study for identification of gene acquisitions in Megavirales |
Aix-Marseille Université |
| BROHARD |
Solène |
2017 |
Thèse |
Tissue expression of paralogous genes: application on the human brain and its pathological state |
Université d'Evry Val d'Essonne |
| Mary-Huard |
Tristan |
2017 |
HDR |
Some contributions to statistical modeling and model selection, with applications to genomics and quantitative genetics |
|
| ABOU-KHATER |
Charbel |
2017 |
Thèse |
Caractérisation de nouveaux gènes et polymorphismes potentiellement impliqués dans les interactions hôtes-pathogènes |
Aix-Marseille Université |
