Thèses et Habilitation à Diriger des Recherches

Nom Prénom Année Diplôme Title Université
Miraglio Benjamin 2018 Thèse Modélisation informatique pour l'évaluation toxicologique
Laporte Fabien 2018 Thèse Développement de méthodes statistiques pour l’identification de gènes d’intérêt en présence d’apparentement et de dominance, application à la génétique du maïs Université Paris-Saclay ; EDMH
Chen Chunlong 2017 HDR Le programme spatio-temporel de réplication et son impact sur la stabilité du génome Institut Curie
Panel Nicolas 2017 Thèse Étude computationnelle du domaine PDZ de Tiam1
Empereur-mot Charly 2017 Thèse Développement d'outils statistiques d'évaluation de méthodes de criblage virtuel : courbes de prédictivité & Screening Explorer CNAM
Collombet Samuel 2017 Thèse Deciphering the regulatory network controlling blood cells specification and reprogramming
Jain Sourabh 2017 Thèse Comparative genomics study for identification of gene acquisitions in Megavirales Aix-Marseille Université
Mary-Huard Tristan 2017 HDR Some contributions to statistical modeling and model selection, with applications to genomics and quantitative genetics
ABOU-KHATER Charbel 2017 Thèse Caractérisation de nouveaux gènes et polymorphismes potentiellement impliqués dans les interactions hôtes-pathogènes Aix-Marseille Université
Vannier Thomas 2017 Thèse Dynamique de la structure des génomes et de leur biogéographie dans l'océan : analyses comparatives des données métagénomiques du projet tara Oceans pour l'étude de la microalgue Bathycoccus et des communautés planctoniques globales
VALSAMOU Dialekti 2017 Thèse Extraction d'information à partir d'articles scientifiques appliquée à la prédiction de régulations biologiques impliquées dans le développement de la graine chez A. Thaliana Université Paris-Saclay
Héliou Alice 2017 Thèse Analyse des séquences génomiques : Identification des ARNs circulaires et calcul de l'information négative
Aubert Julie 2017 Thèse Analyses statistiques de données biologiques à haut-débit AgroParisTech
Héliou Amélie 2017 Thèse Conformations moléculaire et théorie des jeux
REMY Élisabeth 2017 HDR Modélisation logique pour l’analyse des réseaux de régulation biologiques Aix-Marseille Université
Rudewicz Justine 2017 Thèse Méthodes bioinformatiques pour l'analyse de données de séquençage dans le contexte du cancer Université de Bordeaux
Martin Juliette 2017 HDR Bioinformatique Structurale des Interactions Protéine-Protéine ENS Lyon
RAU Andrea 2017 HDR Statistical methods and software for the analysis of transcriptomic data Université d’Evry-Val-d’Essonne
Mercier Jonathan 2017 Thèse Logique paracohérente pour l’annotation fonctionnelle des génomes au travers de réseaux biologiques Genoscope, Evry
Cornillon Emilien 2017 Thèse Modèles qualitatifs de réseaux génétiques : réduction de modèles et introduction d’un temps continu.
Bertaux François 2016 Thèse Cell-based multi-scale modeling for systems and synthetic biology: from stochastic gene expression in single cells to spatially organized cell populations INRIA Paris
FIPPO-FITIME Louis 2016 Thèse Modélisation hybride, analyse et vérification des grands réseaux de régulation biologique Université de Nantes
Nassar Elma 2016 Thèse Modèles Probabilistes de l'Evolution d'une Population dans un Environnement Variable Aix-Marseille Université
DRUART Karen 2016 Thèse Défis algorithmiques pour les simulations biomoléculaires et la conception de protéines CEA Saclay, École Polytechnique
Salle Sandrine 2016 Thèse Evolution des génomes chez les bactéries du super-phylum Planctomycetes-Verrucomicrobiae-Chlamydia Aix-Marseille
CONTRI Benjamin 2016 Thèse Equations de réaction-diffusion dans un environnement périodique en temps - Applications en médecine Aix-Marseille Université
Fumey Julien 2016 Thèse Tempo et mode de l'évolution des populations cavernicoles de l'espèce Astyanax mexicanus Université Paris-sud
DAMERON Olivier 2016 HDR Ontology-based methods for analyzing life science data IRISA, Rennes
Schwaller Loïc 2016 Thèse Exact Bayesian Inference in Graphical Models: Tree-structured Network Inference and Segmentation Agro Paris Tech
Durif Ghislain 2016 Thèse Statistique multivariée pour l'analyse de données de séquençage à haut débit Université Lyon 1
Peterlongo Pierre 2016 HDR Lire les lectures : analyse de données de séquençage IRISA, Rennes
Rougny Adrien 2016 Thèse Méthodes qualitatives pour la construction et l'analyse de réseaux moléculaires SBGN Université Paris-sud
Mouchard Laurent 2016 HDR Contributions algorithmiques à l’analyse des séquences génomiques Université de Rouen
Sorokina Maria 2016 Thèse Découverte et exploration des modules conservés de transformations chimiques dans le métabolisme Ivry, Structure et dynamique des systèmes vivants
Bérard Sèverine 2016 HDR Histoires évolutives et autres comptes. Algorithmes et graphes pour la bioinformatique Université de Montpellier
Giraud Mathieu 2016 HDR Compter les globules blancs, analyser les partitions Université de Lille
Chateau Annie 2016 HDR Des ordres et désordres ou comment bien réarranger son génome Université Montpellier
Chiapello Hélène 2016 HDR Analyse de la microévolution des génomes microbiens : approches bioinformatiques INRA Toulouse
Karami Yasaman 2016 Thèse L'analyse conjointe des réseaux corrélés dynamiquement et des réseaux coévolués de résidus: analyse à grande échelle et méthodes pour prédire les effets des mutations associées à des maladies génétiques Université Pierre et Marie Curie
Magnin Morgan 2016 HDR Contributions à l'élaboration de connaissances qualitatives en bio-informatique Université de Nantes
Elati Mohamed 2016 HDR I3-BioNet: Inférence, interrogation et ingénierie des réseaux biologiques Génopole Evry
Zaag Rim 2016 Thèse Enrichissement de profils transcriptomiques par intégration de données hétérogènes : annotation fonctionnelle de gènes d'Arabidopsis thaliana impliqués dans la réponse aux stress Paris Sud
Brinda Karel 2016 Thèse Novel computational techniques for mapping and classifying Next-Generation Sequencing data Université Paris-Est, Marne-la-Vallée
Thomas-Chollier Morgane 2016 HDR Computational analysis of transcriptional regulation in metazoans ENS, Paris
PIERRE-JEAN Morgane 2016 Thèse Development of statistical methods for DNA copy number analysis in cancerology Université d'Evry Val d'Essonne
TRELLET Mikael 2015 Thèse Exploration et analyse immersives de données moléculaires, guidées par la tâche et la modélisation sémantique des contenus LIMSI et IBPC
KUPERSTEIN Inna 2015 HDR Deciphering cell signaling rewiring in human disorders Université Pierre & Marie Curie - Paris 6
Bernauer Julie 2015 HDR Geometric and statistical methods for the analysis and prediction of structural interactions between biomolecules École Polytechnique, INRIA
Pereira Cécile 2015 Thèse Nouvelles approches bioinformatiques pour l'étude à grande échelle de l'évolution des activités enzymatiques Ecole doctorale : Gènes, Génome, Cellule, Université Paris-Sud
Chiquet Julien 2015 HDR Contributions to sparse methods for complex data analysis Université d'Evry