| Abby |
Sophie |
2010 |
Thèse |
Intérêt des transferts horizontaux de gènes pour comprendre l’histoire évolutive des procaryotes |
Université Claude Bernard (Lyon 1) |
| ABOU-KHATER |
Charbel |
2017 |
Thèse |
Caractérisation de nouveaux gènes et polymorphismes potentiellement impliqués dans les interactions hôtes-pathogènes |
Aix-Marseille Université |
| Abraham |
Anne-Laure |
2008 |
Thèse |
Caractérisation et analyse évolutive des répétitions intragéniques : une étude au niveau des gènes, des séquences protéiques et des structures tridimensionnelles |
|
| Achaz |
Guillaume |
2009 |
HDR |
Evolution moléculaire, des données aux modèles et vice-versa |
Université Paris 6 |
| Acuña |
Vicente |
2010 |
Thèse |
Models and algorithms for metabolic networks: elementary modes and precursor sets |
Université Claude Bernard (Lyon 1) |
| Agier |
Marie |
2006 |
Thèse |
De l’analyse de données d’expression à la reconstruction de réseaux de gènes |
Université Clermont-Ferrand 2 |
| Ahmed |
|
2009 |
Thèse |
Identification et Analyse des Signaux de Codes Circulaires dans les Gènes par des Méthodes Bioinformatiques |
Université de Strasbourg |
| Almeida |
Mathieu |
2013 |
Thèse |
Caractérisation de flores microbiennes intestinale humaine et fromagère par méthode de métagénomique quantitative |
INRA, Jouy en Josas |
| Amara |
Najette |
2011 |
Thèse |
Modélisation de l'évolution dirigée de la tyrosyl-ARNt synthétase |
Ecole Polytechnique |
| AMOR |
Mohamed Hedi BEN |
2012 |
Thèse |
Méthodes numériques et formelles pour l'ingénierie des réseaux biologiques: Traitement de l'information par des populations d'oscillateurs, Approches par contraintes et Taxonomie des réseaux biologiques |
Ecole Doctorale Ingénierie pour la Santé, la Cognition et l'Environnemen, Grenoble |
| Andreani |
Jessica |
2013 |
Thèse |
Analyse évolutive, prédiction structurale et inhibition des interactions protéine-protéine |
Paris 6/7 |
| Andrieux |
Geoffroy |
2013 |
Thèse |
Modélisation dynamique de la signalisation cellulaire : aspects différentiels et discrets; application à la signalisation du facteur de croissance TGF-beta dans le cancer |
Université Rennes 1 |
| Angibaud |
Sébastien |
2009 |
Thèse |
Comparaisons de génomes avec gènes dupliqués : étude théorique et algorithmes |
Université de Nantes |
| Aravena |
Andrés |
2013 |
Thèse |
Probabilistic and constraint based modelling to determine regulation events from heterogeneous biological data |
Univ. Rennes 1 & Univ. Santiago du Chili |
| Arbi |
Oumarou-Abdou |
2013 |
Thèse |
Etude de la variabilité des contributions de nutriments à un réseau métabolique : modélisation, optimisation et application en nutrition |
Université Rennes 1 |
| Arigon |
Anne-Muriel |
2006 |
Thèse |
Développement d’outils pour l’aide à l’identification dans de grandes banques de familles de gènes |
Université Lyon 1, Ecole doctorale Évolution, Écosystèmes, Microbiologie et Modélisation |
| Armisén Giménez |
David |
2008 |
Thèse |
Les genes uniques chez les plantes: caracteristiques, evolution et promoteurs |
Ecole doctorale des Genomes aux Organismes |
| ASSAR |
Rodrigo |
2011 |
Thèse |
Modèles et simulation de systèmes hybrides et des applications pour production cellulaire |
Université de Bordeaux |
| Aubert |
Julie |
2017 |
Thèse |
Analyses statistiques de données biologiques à haut-débit |
AgroParisTech |
| Audit |
Benjamin |
2012 |
HDR |
Multi-scale analysis of the mammalian replication program |
Ecole Normale Supérieure de Lyon |
| Autin |
Ludovic |
2005 |
Thèse |
Analyse des systèmes tenase et prothrombinase par bioinformatique structurale : prédiction de complexes macromoléculaires et proposition d’agents anticoagulants |
Université Paris 5 - UFR des Sciences Pharmaceutiques Ecole Doctorale Médicament Spécialité Modélisation Moléculaire |
| Ayadi |
Wassim |
2011 |
Thèse |
Algorithmes Systématiques et Stochastiques de Biregroupement pour l'Analyse des Données Biopuces |
|
| Azé |
Jérôme |
2012 |
HDR |
Prédiction d'Interactions et Amarrage Protéine-Protéine par combinaison de classifieurs |
Université Paris-Sud, campus d'Orsay |
| Baaden |
Marc |
2010 |
HDR |
Simulations numériques de systèmes biologiques complexes ; dynamique, structure et fonction de transporteurs, canaux et enzymes |
Université Denis Diderot - Paris 7 |
| BABOU |
Hafedh MOHAMED |
2012 |
Thèse |
Comparaison de réseaux biologiques |
École doctorale STIM, Université de Nantes |
| Barba |
Matthieu |
2011 |
Thèse |
Modules réactionnels : un nouveau concept pour étudier l'évolution des réseaux métaboliques |
Université Paris XI |
| Baroukh |
Caroline |
2014 |
Thèse |
Metabolic modeling under non-balanced growth. Application de microalgae for biofuels production |
Science des Procédés, Science des aliments, Univ. Montpellier 2 |
| Basso-Blandin |
Adrien |
2014 |
Thèse |
Conception d’un langage dédié à la conception de fonctions biologiques de synthèse par compilation de spécifications comportementales |
Univ. Evry Val d'Essonne |
| Bastien |
Olivier |
2006 |
Thèse |
Développements théoriques et méthodes numériques pour les analyses comparatives de génomes et protéomes biaisés. Application a la comparaison des génomes et protéomes de Plasmodium falciparum et d’Arabidopsis thaliana |
Université Joseph Fourier, Grenoble |
| Batt |
Grégory |
2006 |
Thèse |
Validation de modèles qualitatifs de réseaux de régulation génique : une méthode basée sur des techniques de vérification formelle |
Université Joseph Fourier |
| Batt |
Gregory |
2014 |
HDR |
Design, Optimization and Control in Systems and Synthetic Biology |
Paris Diderot |
| Batut |
Bérénice |
2014 |
Thèse |
Étude de l'évolution réductive des génomes bactériens par expériences d'évolution in silico et analyses bioinformatiques |
INSA de Lyon |
| Baudot |
Anaïs |
2018 |
HDR |
biologie des réseaux pour l’étude des maladies |
Université de Marseille |
| Baussand |
Julie |
2008 |
Thèse |
Evolution des séquences protéiques: signature structurale hydrophobe et réseaux d'acides aminés co-évolués |
Ecole Doctorale Biochimie et Biologie Moléculaire |
| Beauchene |
Isaure Chauvot |
2013 |
Thèse |
Étude par modélisation et dynamique moléculaire des mécanismes d’activation et de résistance du récepteur tyrosine kinase KIT sauvage et mutant |
ENS Cachan |
| Beaume |
Nicolas |
2008 |
Thèse |
Agrégation de classifieurs et d'experts pour la recherche d'homologues chez les cytokines à quatre hélices alpha |
Faculté de Médecine |
| Bécavin |
Christophe |
2010 |
Thèse |
Dimensionality reduction and pathway network analysis of transcriptomic data: Application to T-cell characterization |
Institut des Hautes Études Scientifiques |
| Becq |
Jennifer |
2008 |
Thèse |
Rôle des transferts horizontaux dans l'évolution de pathogénicité de Mycobacterium tuberculosis |
Université Paris 7 |
| Ben Hamida-Rebaï |
Mériam |
2009 |
Thèse |
Etude du mécanisme d'activation de la petite protéine G Arf1 |
Université de Paris-Sud (Orsay) |
| Benabderrahmane |
Sidahmed |
2011 |
Thèse |
Prise en compte des connaissances du domaine dans l'analyse transcriptomique : similarité sémantique, classification fonctionnelle et profils flous. Application au cancer colorectal |
Université de Nancy |
| Benard |
Emmanuel |
2011 |
Thèse |
Extension des modèles stochastiques de substitution de nucléotides et son implémentation informatique |
Université de Stasbourg |
| Bérard |
Sèverine |
2016 |
HDR |
Histoires évolutives et autres comptes. Algorithmes et graphes pour la bioinformatique |
Université de Montpellier |
| Bérard |
Caroline |
2011 |
Thèse |
Modèles à variables latentes pour des données issues de tiling arrays. Applications aux expériences de ChIP-chip et de transcriptome |
AgroParisTech |
| Bernard |
Thomas |
2008 |
Thèse |
Annotation et prédiction de la spécificité de substrat des enzymes actives sur les sucres |
Ecole Doctorale des Sciences de la Vie et de la Santé, Université de la Méditerranée (Aix-Marseille II) |
| Bernard |
Virginie |
2009 |
Thèse |
Relations entre l'organisation des sites de fixation des facteurs de transcription, la fonction des gènes et l'expression des gènes : vers une annotation des sites de fixation chez Arabidopsis thaliana |
Université d’Evry-Val d’Essonne |
| Bernauer |
Julie |
2015 |
HDR |
Geometric and statistical methods for the analysis and prediction of structural interactions between biomolecules |
École Polytechnique, INRIA |
| Bernauer |
Julie |
2006 |
Thèse |
Utilisation de la tessellation de Voronoï pour la modélisation des complexes protéine-protéine |
Université Paris Sud |
| Berry |
Vincent |
2008 |
HDR |
Construction et comparaison d'arbres - Application aux superarbres en reconstruction phylogénétique |
|
| Bertaux |
François |
2016 |
Thèse |
Cell-based multi-scale modeling for systems and synthetic biology: from stochastic gene expression in single cells to spatially organized cell populations |
INRIA Paris |
| Berthelot |
Camille |
2012 |
Thèse |
Etude des mécanismes évolutifs perturbant l’organisation des gènes dans les génomes de vertébrés |
École doctorale Gènes, Génomes, Cellules, Université Paris XI et ENS |
