| Robelin |
David |
2005 |
Thèse |
Détection de court segments inversés dans les génomes : méthodes et applications |
Université Paris 5, Ecole doctorale Santé |
| Duprat |
Elodie |
2005 |
Thèse |
Caractérisation des domaines des superfamilles IgSF et MhcSF et classification fonctionnelle dans IMGT |
Montpellier 2, Sciences Chimiques et Biologiques |
| Kaas |
Quentin |
2005 |
Thèse |
Analyse structurale des récepteurs d’antigènes dans IMGT et modélisation moléculaire |
Université Montpellier II, Ecole Doctorale : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé |
| Autin |
Ludovic |
2005 |
Thèse |
Analyse des systèmes tenase et prothrombinase par bioinformatique structurale : prédiction de complexes macromoléculaires et proposition d’agents anticoagulants |
Université Paris 5 - UFR des Sciences Pharmaceutiques Ecole Doctorale Médicament Spécialité Modélisation Moléculaire |
| Carpentier |
Mathilde |
2005 |
Thèse |
Méthodes de détection des similarités structurales : caractérisation des motifs conservés dans les familles de structures |
Université Paris VI, Ecole Doctorale Logique du Vivant |
| Calteau |
Alexandra |
2005 |
Thèse |
Relations évolutives entre les bactéries et les archées hyperthermophiles |
Université Claude Bernard - Lyon 1, École Doctorale : Évolution, Écosystèmes, Microbiologie et Modélisation |
| Nicolas |
François |
2005 |
Thèse |
Alignement, séquence consensus, recherche de similarités : complexité et approximabilité |
Montpellier II |
| Jacquemin |
Ingrid |
2005 |
Thèse |
Découverte de motifs relationnels en bioinformatique : application à la prédiction des ponts disulfures |
Université Rennes I, Ecole Doctorale Logique du Vivant |
| Blin |
Guillaume |
2005 |
Thèse |
Combinatoire et Bio-informatique: Comparaison de structures d’ARN et calcul de distances intergénomiques |
Nantes |
| Bertrand |
Denis |
2005 |
Thèse |
Etude et inférence d'arbres de duplication en tandem |
Montpellier II |
| Martin |
Juliette |
2005 |
Thèse |
Prédiction de la structure locale des protéines par des modèles de chaînes de Markov cachées |
Université Paris VII, Ecole doctorale B2M |
| Cohen-Boulakia |
Sarah |
2005 |
Thèse |
Intégration de données biologiques : Sélection de sources centrée sur l’utilisateur |
Université de Paris Sud Orsay |
| Melo_de_Lima |
Christelle |
2005 |
Thèse |
Développement d'une approche markovienne pour l'analyse de l'organisation des génomes |
Université Claude Bernard - Lyon 1 |
| Navratil |
Vincent |
2005 |
Thèse |
Modélisation des connaissances en génomique par une approche de cartographie comparée : Application à la détection et à l'analyse des SNPs exoniques chez les vertébrés |
Université Claude Bernard - Lyon 1 |
| Téletchéa |
Stéphane |
2005 |
Thèse |
Etude par modélisation de dynamique moléculaire et spectroscopie RMN des déformations induites par la coordination du cisplatine sur l’ADN |
|
| Picard |
Franck |
2005 |
Thèse |
Segmentation-Classification de processus : Application à l'analyse des données de microarrays CGH |
Université Paris-sud |
| Richard |
Hugues |
2005 |
Thèse |
Prédiction de la localisation cellulaire des protéines à l’aide de leurs séquences biologiques |
Université d’Evry Val d’Essonne |
| Rivière |
Romain |
2005 |
Thèse |
Algorithmes de graphes pour l'analyse des séquences et structures génomiques |
Université Paris-sud |
| Ponty |
Yann |
2006 |
Thèse |
Modélisation de séquences génomiques, génération aléatoire et applications |
Université Paris Sud |
| Agier |
Marie |
2006 |
Thèse |
De l’analyse de données d’expression à la reconstruction de réseaux de gènes |
Université Clermont-Ferrand 2 |
| Ferey |
Nicolas |
2006 |
Thèse |
Exploration immersive de données génomiques textuelles et factuelles : vers une approche par « Visual Mining » |
Université Paris Sud |
| Jaillon |
Olivier |
2006 |
Thèse |
La séquence du génome de Tetraodon nigroviridis comme outil dans l’inventaire des gènes humains et dans l’analyse de l’évolution des chromosomes de vertébrés |
Université d’Evry |
| Richard |
Adrien |
2006 |
Thèse |
Modèle formel pour les réseaux de régulation génétique et influence des circuits de rétroaction |
Université d’Evry |
| Calimet |
Nicolas |
2006 |
Thèse |
Reconnaissance protéine-protéine : Modélisation d’effets electrostatiques et de solvatation |
Universités Paris 6 et Paris 7, École Doctorale de Biochimie et Biologie Moléculaire |
| Knibbe |
Carole |
2006 |
Thèse |
Structuration des génomes par sélection indirecte de la variabilité mutationnelle : Une approche de modélisation et de simulation |
Institut National des Sciences Appliquées de Lyon, École doctorale Évolution, Ecosystèmes, Microbiologie et Modélisation |
| Bastien |
Olivier |
2006 |
Thèse |
Développements théoriques et méthodes numériques pour les analyses comparatives de génomes et protéomes biaisés. Application a la comparaison des génomes et protéomes de Plasmodium falciparum et d’Arabidopsis thaliana |
Université Joseph Fourier, Grenoble |
| Stam |
Mark |
2006 |
Thèse |
Évolution et prédiction des activités des glycoside hydrolases |
Université d’Aix-Marseille 1 & 2, École doctorale Bioinformatique, Biochimie Structurale et Génomique |
| Criscuolo |
Alexis |
2006 |
Thèse |
Méthodes de distance pour l’inférence phylogénomique |
Université de Montpellier 2 |
| Mahé |
Pierre |
2006 |
Thèse |
Fonctions noyaux pour molécules et leur application au criblage virtuel par machines à vecteur support |
Ecole des Mines de Paris |
| Manh |
Thien-Phong Vu |
2006 |
Thèse |
Fly Genome Explorer : a versatile tool for the exploration and the exploitation of structural and functional annotations related to Drosophila melanogaster genes ; Application to a Drosophila model for the study of hypertrophic cardiomyopathies. |
Université d’Aix-Marseille 2, Ecole Doctorale des Sciences de la Vie et de la Santé |
| Defrance |
Matthieu |
2006 |
Thèse |
Algorithmes pour l’analyse de régions régulatrices dans le génome d’eucaryotes supérieurs |
Université des Sciences et Technologies de Lille, Ecole doctorale d’Informatique |
| Manine |
Alain-Pierre |
2006 |
Thèse |
Application de l’apprentissage à l’extraction de connaissances à partir de notices bibliographiques en génomique |
Université Paris Sud |
| Lespinats |
Sylvain |
2006 |
Thèse |
Style du génome exploré par analyse textuelle de l’ADN |
École doctorale Santé Public: Épidémiologie et Sciences de l’Information Biomédicale |
| Batt |
Grégory |
2006 |
Thèse |
Validation de modèles qualitatifs de réseaux de régulation génique : une méthode basée sur des techniques de vérification formelle |
Université Joseph Fourier |
| Denoeud |
Lucile |
2006 |
Thèse |
Etude de la distance de transfert entre partitions et recherche de zones denses dans un graphe |
Université Paris 1 |
| Martin |
Laétitia |
2006 |
Thèse |
Développement d’une plateforme bioinformatique d’outils pour la modéli !sation des structures et pour le criblage virtuel comparatif. Une application sur la protéine kinase FAK |
Université de Montpellier 2 |
| Choulet |
Frédéric |
2006 |
Thèse |
Evolution du chromosome linéaire des Streptomyces : transfert horizontal et variabilité des extrémités chromosomiques |
Université Nancy 1 |
| Djebali |
Sarah |
2006 |
Thèse |
Un cadre formel pour l’annotation experte des gènes eucaryotes |
École Normale Supérieure et Université d’Evry |
| Mary-Huard |
Tristan |
2006 |
Thèse |
Réduction de la dimension et sélection de modèles en classification supervisée |
Université Paris Sud |
| Dutheil |
Julien |
2006 |
Thèse |
Approches phylogénétiques et bioinformatiques pour l’analyse de la coévolution à l’échelle moléculaire |
Université Montpellier 2, Ecole Doctorale : Biologie des Systèmes Intégrés, Agronomie – Environnement |
| Bernauer |
Julie |
2006 |
Thèse |
Utilisation de la tessellation de Voronoï pour la modélisation des complexes protéine-protéine |
Université Paris Sud |
| Arigon |
Anne-Muriel |
2006 |
Thèse |
Développement d’outils pour l’aide à l’identification dans de grandes banques de familles de gènes |
Université Lyon 1, Ecole doctorale Évolution, Écosystèmes, Microbiologie et Modélisation |
| Carpentier |
Anne-Sophie |
2006 |
Thèse |
Le transcriptome : un domaine d’application pour les statistiques, de nouveaux horizons pour la biologie |
Université d’Évry, École doctorale Des Génomes aux Organismes |
| Gonzalez |
Aitor |
2006 |
Thèse |
Modélisation et analyse logique d’un réseau de régulation impliqué dans la mise en place d’une frontière développementale |
Université d’Aix-Marseille 2 |
| Dulin |
Fabienne |
2006 |
Thèse |
Exploration des caractéristiques tridimensionnelles des amas protéiques hydrophobes issus du formalisme "Hydrophobic Cluster Analysis" (HCA). Modélisation de formes oligomériques solubles du peptide Abeta impliqué dans la maladie d’Alzheimer, et identific |
Université Paris 6, École doctorale Inter-Bio |
| Meyroneine |
Arnaud |
2006 |
Thèse |
Genetic regulatory networks and allelic exclusion : discrete-time piecewise-linear models |
Université d’Aix-Marseille 2, École doctorale Physique et Sciences de la Matière |
| Engelen |
Stefan |
2006 |
Thèse |
Algorithmes pour la prédiction de structures secondaires des ARN |
Université d’Évry, École doctorale Des Génomes aux Organismes |
| Kerdélo |
Sébastien |
2006 |
Thèse |
Méthodes informatiques pour l’expérimentation in virtuo de la cinétique biochimique : application à la coagulation du sang |
Université de Rennes 1, École doctorale Matisse |
| Eudes |
Richard |
2006 |
Thèse |
Développements méthodologiques relatifs à l’attribution et à la prédiction des structures secondaires des protéines globulaires. Classification structurale de mutations du transporteur CFTR, observées chez des patients atteints de mucoviscidose |
Université Paris 6, Ecole doctorale Interfaces de la Chimie, de la Physique et de l’Informatique avec la Biologie |
| Pasek |
Sophie |
2006 |
Thèse |
Le domaine protéique, une unité d’homologie pertinente en génomique comparative |
Université d’Evry |
