Bienvenue sur le site web de la SFBI

La Société Française de BioInformatique (SFBI) a été créée en 2005 pour promouvoir la recherche pluri- et inter-disciplinaire en Bioinformatique, à l'interface entre la Biologie moléculaire, l'Informatique, les Mathématiques et la Physique.

La SFBI a vocation à rassembler les chercheurs, enseignants et ingénieurs francophones qui travaillent sur des questions relevant de la bioinformatique, pour des rencontres et des échanges scientifiques. Elle participe et assure la pérénité de l'organisation de JOBIM, conférence nationale annuelle de bioinformatique qui réunit de 300 à 500 personnes.


La SFBI assure la diffusion au sein de la communauté bioinformatique francophone (liste de diffusion modérée bioinfo [at] sfbi [dot] fr) d'offres de recrutements, de stages et de thèses, et d'informations sur les formations en bioinformatique, sur les manifestations scientifiques nationales et internationales relevant de la bioinformatique.

Ce site se veut une vitrine de la recherche et de la formation en  bioinformatique en France.

 

Pour tous renseignements : sfbi [dot] contact [at] gmail [dot] com

 

 

Brèves

Le bureau de la SFBI s'associe aux messages et hommages ci-dessous, nous sommes très marqués par la disparition de Christophe.

Si vous souhaitez laisser un témoignage, merci d'utiliser le système de commentaires ci-dessous.

Morgane Thomas-Chollier et Hélène Chiapello, pour le bureau de la SFBI

Message du 5 mai 2018 de Jacques van Helden et Claudine Medigue (IFB):

C'est avec une immense tristesse, et dans un état de choc total, que nous vous faisons part du décès de Christophe Caron, survenu hier en fin de journée suite à une crise cardiaque, alors qu'il s'adonnait à son sport favori : le foot (il était défenseur droit...).

Christophe était apprécié de nous tous pour son enthousiasme, son dynamisme, sa volonté de faire avancer tout ce qu'il entreprenait, sa capacité à fédérer, son amour du travail collectif, son égale bonne humeur et sa joie de vivre... la liste est longue.

Son investissement a profondément marqué la communauté bioinformatique et notamment l'IFB, dont il fut un pionnier de plusieurs actions (communauté Galaxy, développement de ressources en lien avec MetaboHub, e-learning) et devint  un moteur de la réorientation, en tant que co-concepteur du projet 2018-2021, responsable du déploiement d'un réseau distribué de ressources informatiques, pilote de la task force mutualisée, et membre du collège de direction.

Christophe laissera une trace durable dans nos esprits; il va terriblement nous manquer !

Bien amicalement,

Jacques et Claudine

 

Message du 7 mai 2018 de Hervé Monod pour l'INRA:

Chers collègues,

C'est avec une très grande tristesse que nous vous faisons part du décès de Christophe Caron, survenu brutalement vendredi 4 mai au cours d’une activité sportive. Christophe était ingénieur de recherche INRA et directeur de l'unité Ingenum (département MIA) située sur le centre de Toulouse.

Les obsèques de Christophe auront lieu le mercredi 9 mai à 14h30 à la Chapelle Saint Pierre de Saint Pol de Léon. Une dernière visite peut lui être rendue au centre funéraire dans la zone de Kervent. Il sera ensuite inhumé à Plougernevel près de Rostenen. 

Cette nouvelle est un choc pour beaucoup d'entre nous, car Christophe était une personne très dynamique et avide de contacts, à la croisée de nombreux chantiers d'importance pour l'institut dans le cadre de la bioinformatique et du numérique.

Christophe a exercé ses activités professionnelles au centre INRA de Jouy-en-Josas de 1993 à 2008, période au cours de laquelle il est devenu ingénieur diplômé du CNAM en informatique. Technicien réseau puis ingénieur « systèmes et réseaux » pour la direction informatique de Jouy, Christophe a ensuite joué un rôle essentiel pour l’unité MIG (Mathématique, Informatique et Génome), commune à trois départements INRA et pionnière de la bioinformatique, en particulier en créant la plateforme Migale. De fin 2008 à 2016, Christophe a été recruté par le CNRS comme responsable du service informatique et bio-informatique de la Station Biologique de Roscoff, assurant le développement d'une autre plateforme de bioinformatique (ABiMS pour "Analysis and Bioinformatics for Marine Science") et la co-coordination de l'axe bio-informatique du dispositif inter-régional Biogenouest. C'est pendant cette période qu'il est devenu membre du comité de pilotage de l'Institut Français de Bioinformatique (IFB) et qu’il a initié la structuration de la communauté Galaxy française. 

Revenu à l'INRA début 2016, Christophe a participé à l'aventure de l'unité Ingenum, créée sur le centre de Toulouse au sein du département MIA et sous l'égide du DTN (Délégué à la Transition Numérique). La vocation d'Ingenum est d'accompagner les unités des départements de recherche de l'INRA pour qu'elles répondent aux défis de la transition numérique. L'attrait pour cette mission a conduit Christophe à travailler à l'élaboration d'une nouvelle feuille de route pour Ingenum, à mobiliser des ingénieurs pour l'accompagner et à prendre la direction officielle de l'unité depuis le 1er février 2018. Dans ce cadre, Christophe était impliqué dans de nombreux chantiers INRA liés au numérique et à vocation très transversale: AgroDataRing, CATIs 3G, e-infrastructures, catalogue des actifs stratégiques, pépinière SDN, etc. Loin de se satisfaire de ces seules activités, Christophe s'était fortement investi en parallèle dans le nouveau projet de l'IFB porté par Claudine Médigue (CNRS) et Jacques van Helden (AMU), pour lequel il copilotait le workpackage Infrastructures de Calcul et dont il avait été nommé membre du comité de direction. Il était également co-initiateur et co-porteur de la toute récente e-infrastructure OMeR dédiée à l’analyse de données de métabolomique.

Fort de ces multiples activités et voyageur infatigable, Christophe était en relation avec un nombre incalculable de collègues à l'INRA et en dehors de l'INRA, qui ont tous eu l'occasion d'apprécier ses compétences, son esprit créatif et collectif, sa volonté d'entraîner les autres avec conviction et bienveillance. Les témoignages convergent pour louer ses qualités humaines et professionnelles exceptionnelles et pour regretter que leur cours soit interrompu si brusquement. 

Avec Christine Cherbut, directrice générale déléguée à la science de l’INRA, de très nombreux collègues de Christophe s’associent à nous pour témoigner de leur sincères condoléances à sa famille, à ses amis et à ses collègues les plus proches. 

Hervé Monod (CD MIA), Michaël Chelle (DTN), Hélène Chiapello, Christine Cierco-Ayrolles, Christine Gaspin, Sophie Schbath

 

Message du 31 mai 2018 de Cécile Ghesquière, compagne de Christophe:

 

 

Bravo à Pierre Pericard qui a remporté le prix de la meilleur présentation orale décerné par la SFBI, et à Aurélien Birer et Pierre Andrieu qui ont reçu les prix des deux meilleurs posters !

Voir tous les prix SFBI à JOBIM.

 

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