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Mini-symposium JOBIM 2026 "Interactions internationales en bioinformatique"

Intitulé complet : Mini-symposium JOBIM 2026 "Interactions internationales en bioinformatique autour des technologies de séquençage appliquées à la santé et à l’agriculture"

Date : 2 juillet (après-midi) pendant JOBIM 2026 à Strasbourg

Ce mini-symposium propose une session thématique consacrée aux interactions internationales portées par la Société Française de Bioinformatique (SFBI). Il a pour objectif de favoriser les échanges scientifiques et institutionnels entre communautés de bioinformatique et de biologie computationnelle.

Dans un contexte où les collaborations internationales jouent un rôle central dans le développement de projets interdisciplinaires et l’émergence de nouvelles approches méthodologiques, cette session offrira un espace de discussion structuré autour des enjeux, opportunités et défis associés à ces coopérations, notamment dans les domaines de la santé et de l’agriculture.

Deux professeur·e·s partageront leurs travaux de recherche et leur vision des dynamiques internationales en bioinformatique :

Professeure Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos, chercheuse senior au Laboratoire National de Calcul Scientifique (LNCC, Laboratório Nacional de Computação Científica), qui dépend directement du Ministère brésilien de la Science, de la Technologie et de l'Innovation. Elle dirige le Laboratoire de bioinformatique du LNCC et l'unité de génomique computationnelle Darcy Fontoura de Almeida. Elle est membre titulaire de l'Académie brésilienne des sciences (ABC, Brazilian Academy of Sciences), membre de la Société internationale de biologie computationnelle (ISCB, International Society for Computational Biology) et membre de l’Académie mondiale des sciences pour le développement de la science dans les pays en développement (TWAS, The World Academy of Sciences). Elle a été la première présidente de l'Association brésilienne de bioinformatique et de biologie computationnelle (AB3C, la société brésilienne de bioinformatique).

Professeur Justin PITA est Professeur Associé au département de pathologie végétale et de microbiologie environnementale du College of Agricultural Sciences de Pennsylvania State University (USA) et Maître de Conférences à l’Université Félix HOUPHOUËT-BOIGNY (Côte d’Ivoire). Il cumule plus de 25 ans d’expérience dans la recherche sur la santé des plantes, particulièrement sur l’épidémiologie des maladies virales et l’évolution des virus, dans des institutions de renom aux États-Unis et en Afrique, comme WAVE (Central and West African Virus Epidemiology) dont il est le Fondateur et le Directeur Exécutif. WAVE est présent dans 14 pays d’Afrique du centre et de l’ouest (ACO) regroupant 17 centres de recherche et universités. Son programme de recherches pour le développement en ACO porte sur le diagnostic et la surveillance des pathogènes des plantes intégrant des approches de séquençage haut débit, la modélisation et la bioinformatique ainsi que sur le renforcement des capacités infrastructurelles et humaines.

Les interventions seront suivies de présentations très courtes par des scientifiques du Brésil et d'Afrique Centrale et de l'Ouest, puis d’un temps d’échange visant à identifier et discuter les perspectives de futures collaborations et interactions entre nos réseaux. 

Ce mini-symposium s’adresse à l’ensemble des participant·e·s intéressé·e·s par les dimensions collaboratives, organisationnelles et scientifiques de la bioinformatique et de la biologie computationnelle. Les partenariats envisagés pourront prendre différentes formes : montage de projets communs, accueil croisé de scientifiques, ou encore organisation de workshops et de formations communes sur les thématiques pour lesquelles des besoins seront identifiés. Un focus sera porté sur les enjeux liés à la gestion des données, aux infrastructures de calcul et aux principes de la science ouverte.

La participation est ouverte à l’ensemble des participants de JOBIM. Le mini-symposium sera accessible en visioconférence.

Programme

15h - 15h05 : Introduction

15h05 - 15h45 : Bioinformatics in Brazil: From genomic networks to multiomics integration: building science in a megadiverse nation - Professeure Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos

15h45 - 16h : 3 présentations Flash Brésil

   1) Program's Coding: The Code of Life - A pilot project for applying bioinformatics in high school education - Helena Lott Costa Rocha
   2) Plant Parasitism and Metal Transport: Complementary Narratives of Evolution and Molecular Innovation in Plants - Wenderson Felipe Costa Rodrigues
   3) EpiBuilder 2.0: A Dockerized Web Platform for In Silico Prediction and Analysis of Linear B-Cell Epitopes - Bruna Caroline Russi

16h - 16h30 : pause

16h30 - 17h10 : Bridging the gap in computational biology: genomic surveillance and bioinformatic innovation for plant health and food security in Africa - Professeur Justin PITA

17h10 - 17h30 : 3 présentations Flash Afrique de l'Ouest

   1) A Spatially Explicit Delay-Differential Framework for Optimal Disease Surveillance in Clonally Propagated Plants - Koissi SAVI
   2) Enhancing Genomic Prediction Accuracy for Complex Traits in Cassava (Manihot esculenta) Through Pangenome-Informed Variant Calling - Oloruntoba Isaac ABEGUNDE
   3) Optimizing de novo assembly of RCA-enriched circular ssDNA viral genomes using long-read sequencing - Pakyendou Estel NAME 

17h30 - 17h50 : table ronde sur les enjeux scientifiques (gestion, science ouverte, collaborations et les connexions possibles entre ces différents réseaux)

Organisat·eur/rice·s & Sponsors