Illustrations des métiers
La bioinformatique est comme son nom l'indique à l'interface entre la biologie et l'informatique. C'est un domaine scientifique aux multiples facettes pour répondre à la demande du traîtement des données complexes que sont les données en biologie, mais égalemement est déploiement de méthodes ou d'outils. Par ailleurs la recherche en tant que telle en bioinformatique se développe.
Dans les pages qui suivent et qui suivront, vous trouverez plusieurs interviews d'un.e bioinformaticien.ne et d'une ou deux personnes avec qui il/elle collabore (biologiste, informaticien, statisticien, ...) pour illustrer les différents métiers de la bioinformatique, leur contexte et domaine d'application.
Nous espérons que ces témoignages, inspireront les jeunes et les moins jeunes, et peut être même des envies de participer pour témoigner à votre tour.
L’expert (en bioinformatique) au coeur du système (informatique)
Le 07/06/2022
Patricia Thébaut, maître de conférence en bioinformatique, et Romain Bourqui, maître de conférence en informatique, tous deux à l’université de Bordeaux et dans le laboratoire LaBRI, nous expliquent le concept (et les difficultés) de formalisation du vivant, ce qui les as amené à développer un outil de visualisation dédié aux interactions entre petits ARNs.
Mutualisme entre une bioinformaticienne de plateforme et un (chercheur) biologiste
Le 02/06/2022
Stéphanie Le Gras, ingénieure bioinformaticienne sur la plateforme GenomEast, et Christophe Papin, biologiste chargé de recherche à l’IGBMC, partagent avec nous leur collaboration de long terme basée sur un apprentissage réciproque des problématiques, faisant avancer les expertises de chacun et aboutissant ainsi à des résultats scientifiques de plus en plus aboutis.
Enseignante-Chercheuse
Le 24/11/2022
Anna-Sophie Fiston-Lavier (présidente de la SFBI par ailleurs) est maîtresse de conférence au sein de l'Université de Montpellier et effectue ses recherches à l’Institut des Sciences de l’Evolution de Montpellier (ISEM). Son temps se partage entre l'enseignement avec un attrait pour l'innovation pédagogique, et le développement de méthodes pour étudier l'impact de la dynamique d'insertion et délétion des éléments transposables dans les génomes.
Ingénieur de Recherche en Calcul Scientifique
Le 24/11/2022
Erwan Corre (également membre du bureau de la SFBI) est responsable de la plateforme Analysis and Bioinformatics for Marine Science (ABiMS) de Roscoff. Il est impliqué dans le pilotage et le développement de l'infrastructure informatique de la plateforme pour anticiper et répondre aux besoins locaux mais aussi nationaux. Il est également bio-analyste et accompagne des biologistes dans leurs projets d'étude des organismes et environnements marins pour lesquels ils produisent des données (méta)-génomique/transcriptomique.
Chargé de Recherche en Informatique
Le 25/11/2022
Matthias Zytnicki (également membre du bureau de la SFBI) est un chercheur en informatique à l'INRAe de Toulouse qui partage son temps entre l'équipe Statistiques et Algorithmique pour la Biologie (SaAB) et la plateforme GenoToul-Bioinfo. Au travers de ses collaborations avec les biologistes, il tente d'identifier des questions pour lesquelles il n'y a pas de solutions informatiques et développe des outils qui s'adresseraient au plus grand nombre.