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Qu'est-ce qu'un.e bioinformaticien.ne ?

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Fiche métier générique bioinformaticien produite par le groupe de la travail sur les métiers de la Bioinformatique (MetBif) de la Société Française de Bioinformatique (SFBI).

Où trouver les offres d'emploi/stage.... via le site de la SFBI

La SFBI se donne pour mission de mettre à disposition de la communauté bioinformaticienne française un support de diffusion d'offres d'emplois et de stage dans le domaine de la bioinformatique évidemment mais plus largement en informatique et en (bio)statistiques.

 Les offres en cours sont catégorisées selon le niveau détude (minimum pour les offres d'emplois, en cours pour les offres de stages), le type de poste (ingénieur, chercheur, ...), le type de contrat et leur durée, le lieu et les dates importantes de l'annonce. Les annonces sont majoritairement française, mais nous avons de plus en plus de proposition ailleurs dans le monde.

Ces offres sont classées selon leur date de publication, mais n'hésitez pas à filtrer trier et explorer l'ensemble des annonces. Par ailleurs, nous maintenons une liste de diffusion pour recevoir chaque semaine les nouvelles offres.

Comment connaitre les domaines les plus demandeurs ?

Chaque année, la SFBI publie un bilan des offres proposées sur l'année passée. Cela nous permet de suivre les tendances en terme de types d'emplois, mais aussi thématiques, ou zones géographiques

- Le premier bilan, pour l'année 2021 (à partir d'avril), fait état de 735 annonces. Consultez l'article détaillé pour visualiser leur répartition.

- Bilan année 2022 (Janvier-Décembre), 1044 annonces ont été publiées. Plus de détails dans cet article.

- Bilan année 2023 (Janvier-Décembre), 866 annonces ont été publiées. Plus de détails dans cet article

- Bilan année 2024 (Janvier-Décembre), 822 annonces ont été publiées. Plus de détails dans cet article

- Bilan année 2025 (Janvier-Décembre), 682 annonces ont été publiées. Plus de détails dans cet article

Et après, se faire un réseau : l'exemple de MERIT et de BioInfoDiag

Le Réseau MetiER en bIoinformaTique (MERIT) vise à fédérer les ingénieurs en bioinformatique des établissements d’Enseignement Supérieur et Recherche (ESR) à l’échelle nationale afin de contribuer à structurer cette communauté en favorisant les échanges.

Le Réseau Français de Bioinformatique pour le Diagnostic (BioInfoDiag) est une association Loi 1901 qui vise à  regrouper les différentes communautés d’utilisateurs et de développeurs d’algorithmes et de pipelines bioinformatiques pour le diagnostic et la prise en charge des pathologies humaines en lien direct ou indirect avec la génomique.

Rencontre des réseaux ouest-africains et français autour de la bioinformatique

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Du 15 au 17 décembre 2025, une délégation de l’Institut Français de Bioinformatique (IFB/ELIXIR-FR), de la Société Française de Bioinformatique (SFBI) et de l’Université de Montpellier a été invitée au lancement du Réseau ouest Africain des Bioinformaticiens et Administrateurs de Systèmes (RABIAS), organisé par le centre de recherche d’excellence WAVE (Central and West African Virus Epidemiology for Food Security) et l’IRD (Institut de Recherche pour le Développement).

L’initiative RABIAS fait suite à la deuxième édition du Certificat International de Bioinformatique et Génomique (CIBiG) en Afrique de l’Ouest et à une formation au cluster HPC d’un groupe d’administrateurs systèmes de pays de la sous-région. Le réseau RABIAS a pour objectif de fédérer les communautés de bioinformaticiens, d’administrateurs systèmes et d’usagers de la région ouest africaine afin d’impulser la mutualisation de ressources humaines et matérielles et de stimuler la montée en compétence des équipes de recherche locales.

La rencontre réunissait à Abidjan (Côte d’Ivoire) les acteurs clés du séquençage, de la bioinformatique, et de l’administration systèmes des ressources de calcul de la région ouest africaine (Côte d’Ivoire, Burkina Faso, Bénin, Nigéria, Togo, Tchad, République Démocratique du Congo, Ghana, Guinée et Niger), ainsi que des représentants de l’African Society for Bioinformatics and Computational Biology (ASBCB) et du Pan African Bioinformatics Network (H3ABioNet).

Les trois journées alternaient présentations, retours d’expériences et ateliers en petits groupes afin de définir les besoins, les moyens et les priorités stratégiques. Les présentations scientifiques fournissaient un aperçu de travaux de recherche dans les domaines phares tels que génomique humaine, surveillance génomique des pathogènes, phytopathologie, résistances aux antimicrobiens, ainsi que les enjeux liés au déploiement d’infrastructures HPC distribuées.

Retours d’expériences des instances françaises invitées

Afin d’illustrer la complexité des problématiques liées au montage de réseaux, les acteurs invités ont partagé leurs expériences concernant la formation, l’infrastructure et la mutualisation des ressources (matériel et humains). L’IFB a présenté sa structuration en tant que fédération de plateformes régionales et que noeud français du réseau ELIXIR, l’organisation de son réseau national de ressources numériques (NNCR), et ses actions de formation continue et de développement des compétences. L’Université de Montpellier (UM) a présenté un panorama des formations diplômantes en France, suivi d’un focus sur son Master en Bioinformatique, mettant en avant l’apport des nouvelles approches pédagogiques des Montpellier Omics Days et du Bioinformatics Learning Lab. La SFBI a présenté son organisation et ses principales missions, en mettant l’accent sur ses interactions avec les autres acteurs de la bioinformatique française ainsi que d’autres réseaux internationaux de bioinformatique.

L’ensemble des discussions et des ateliers de travail ont permis d’identifier des priorités et des actions à mettre en œuvre pour le développement et la maturation du réseau RABIAS. À l’issue de cette rencontre un comité directeur inter-instituts et international a été identifié et des groupes de travail constitués par des participants ont pris l’engagement de mettre en œuvre les actions prioritaires planifiées pour 2026. Cette rencontre a permis de poser les premiers jalons du réseau et de montrer le dynamisme et l’implication de la communauté dans cette initiative. Rendez-vous est pris pour une future édition !

Collaboration SFBI & Métal Hurlant

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L’ADN dans tous ses états : un dialogue entre science, art et société

En 2027, le CNRS organisera l’année thématique « L’ADN dans tous ses états », une initiative dédiée à explorer les multiples dimensions de cette molécule essentielle, des avancées scientifiques aux enjeux sociétaux. Coordonnée par les Groupes de Recherche du CNRS Bioinformatique Moléculaire: Modélisation et Méthodologie (BIMMM) et Informatique Fondamentale et ses Mathématiques (IFM), en partenariat avec la Société Française de BioInformatique (SFBI), cette année promet de rassembler chercheurs, artistes et citoyens autour d’une réflexion collective.

Un numéro spécial avec Métal Hurlant : quand la science inspire l’art

Dans ce cadre, la SFBI s’associe à la revue mythique Métal Hurlant, où science, art et narration se croisent depuis des décennies. L’objectif ? Créer un numéro spécial dédié à l’ADN, où des trinômes chercheur-scénariste-dessinateur collaboreront pour donner vie à des récits visuels et littéraires inédits. Ces collaborations, facilitées par le collectif La Coulisse, exploreront les thèmes de nos recherches et pourront être aussi variés que :

• l’intelligence artificielle appliquée à l’ADN,
• les modifications génétiques par CRISPR,
• la biologie de synthèse,
• la métagénomique,
• l'évolution,
• le stockage de l’information sur molécule d’ADN,
• etc.

Allier rigueur scientifique et liberté créative

Ce projet ambitionne de démocratiser la complexité tout en suscitant curiosité, émotion et réflexion. En associant chercheurs (doctorants, post-doctorants, chercheurs statutaires) et créateurs, il s’agit de proposer une plongée dans l’ADN à la fois informative, sensible et stimulante pour partager le fruit de nos recherches de manière innovante et accessible.

Processus de sélection des propositions

Les propositions seront évaluées en deux temps : un comité scientifique ad hoc examinera d’abord leur pertinence thématique, leur originalité et leur cohérence pédagogique, avec la possibilité de fusionner certaines d’entre elles pour enrichir leur portée. Les projets présélectionnés seront ensuite soumis à la rédaction de Métal Hurlant, qui effectuera une sélection finale fondée sur leur force narrative et leur potentiel visuel. Compte tenu de ces contraintes éditoriales, certaines propositions ne pourront malheureusement pas être retenues dans ce numéro spécial.

En participant à ce projet, vous vous engagez à :

• Faire une proposition (descriptif grand public de vos travaux de recherche en 200 mots maximum) en accord avec vos thématiques de recherche et votre expertise ;
• Collaborer activement avec des scénaristes et des dessinateurs et, éventuellement, d'autres chercheurs.es, via des échanges réguliers, des réunions de travail et un suivi scientifique des récits, possiblement en anglais ;
• Vous investir sur plusieurs mois pour accompagner la création des œuvres, en apportant votre expertise tout en laissant une liberté artistique aux créateurs ;

• Voir vos travaux interprétés librement : les récits s’inspireront de vos recherches, mais ne chercheront pas à en offrir une représentation littérale ou complète.

Ce qu’on attend de vous

• Disponibilité et réactivité : participez aux échanges et réunions pour éclairer les artistes sur les aspects scientifiques, tout en respectant leur processus créatif ;
• Ouverture d’esprit : acceptez que les récits explorent des angles originaux, parfois éloignés d’une vision strictement académique ;
• Flexibilité : certaines propositions pourront être fusionnées, impliquant des équipes de chercheurs plutôt que des contributions individuelles.

Pour participer (date limite 22 Avril 2026) : https://www.sfbi.fr/survey/index.php?r=survey/index&sid=388832&newtest=Y&lang=fr.

Boutique Tunetoo inacessible

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Nous vous informons que la boutique Tunetoo SFBI a été désactivée pour une durée indéterminée.

Le bureau de la SFBI essaie d'entrer en contact avec la société Tunetoo depuis maintenant plusieurs mois mais sans succés.

Tant que nous n'aurons pas réussi à avoir des informations de la part concernant notre boutique, celle-ci sera désactivée.

Nous nous excusons pour la gène occasionnée.

Maîtresse de conférence multi-facettes

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Le 18/12/2024

Carte d'identité:

Entretien

Quels sont vos domaines de recherche ou d’expertise ?

En tant que maîtresse de conférence, il y a deux volets à mon métier. Côté enseignement, j’ai une expertise pédagogique, à la fois en formation initiale pour les étudiant·es de mon établissement, mais aussi en formation continue. Je reste très motivée par le challenge d’enseigner la bioinformatique à un public issu de la biologie. Côté recherche, c’est en génomique !  Initialement en épigénomique, puis en transcriptomique. En rejoignant la plateforme GenomiqueENS, je me suis rapprochée des séquenceurs, et je reste encore aujourd’hui fascinée par ces machines et leur technologie.

En tant que responsable scientifique de cette plateforme, et comme une des directrices adjointes de l’Institut Français de Bioinformatique (IFB), mon expertise se situe autour du management, du pilotage stratégique, d’animation de réseau, et de représentation. Des activités dont je ne connaissais pas vraiment l’existence il y a encore quelques années !

Quel rôles exercez-vous ? Concrètement, en quoi cela consiste ?

Auprès des étudiant·es de l’ENS et des thésard·es que j’encadre, mon rôle est de les accompagner dans leurs apprentissages de la bioinformatique, en les suivant sur plusieurs années vers leur projet professionnel.

Au sein de la plateforme, mon rôle est d’assurer que l’équipe a tout ce qu’il faut pour mener leurs propres missions. J’apporte mon expertise scientifique pour nos projets de recherche et développement, basés sur les domaines d’expertises de nos ingénieur·es, en particulier la transcriptomique en lecture longue Nanopore.

Au sein de l’IFB, mon rôle est entre autres d’animer le réseau des plateformes, distribué sur toute la France.  Concrètement, j’organise des réunions, et beaucoup de visioconférences !

Collaborez-vous avec des biologistes ? Quel type de collaboration est-ce ?

La plateforme permet aux chercheurs de réaliser leurs projets de transcriptomique, de l’échantillon jusqu’à l’analyse bioinformatique et la publication des résultats. Notre équipe comporte donc des ingénieur·es biologistes en charge de la partie expérimentale, et des ingénieur·es  en bioinformatique. Collaborer avec des biologistes est donc au cœur même de notre organisation, et de nos activités avec les chercheurs.

Quel avenir imaginez-vous pour la bioinformatique ?

La bioinformatique n’échappe pas à la révolution qu’apporte l’intelligence artificielle. Dans les années à venir, le développement de nouvelles méthodes va être foisonnant ! Pour autant, l’accessibilité des outils bioinformatiques de pointe ne peut pas se restreindre aux seuls bioinformaticien·nes. Un des enjeux est d’assurer des interfaces adaptées aux biologistes, sur des infrastructures de calcul haute-performance. L’IFB joue un rôle clef en France sur ces aspects, et aussi pour former les biologistes à la bioinformatique, leur permettant ainsi de mieux communiquer avec les bioinformaticien·nes et de répondre à leurs questions biologiques. Enfin, un des enjeux de la bioinformatique est d’assurer la reproductibilité des analyses, la mise à disposition de données (vraiment) réutilisables, dans un contexte de science ouverte.

Votre message à destination des étudiants/jeunes bioinformaticien·nes ?

La communauté française en bioinformatique est vraiment dynamique et sympa. Ne restez pas seul·e dans votre coin ! Etape 1 : adhérez gratuitement à l’association Jebif, ils sont là pour vous donner plein de conseils et vous faire rencontrer d’autres jeunes bioinformacien·nes. Etape 2 : lisez le blog bioinfo-fr.net et découvrez leur canal discord. Etape 3 : élargissez encore un peu vos horizons en lisant la newsletter Les Bioinformations. Etape 4 : vous êtes en stage/thèse/contrat => rendez-vous à JOBIM, l'événement annuel de la bioinformatique piloté par la SFBI, pour y présenter vos travaux pour la première fois, et rencontrer la communauté. Etape 5 : envie de travailler avec d’autres bioinformaticien·nes ? Identifier les réseaux près de chez vous et les groupes de travail thématiques via le réseau métier MERIT.