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Décès - Bernard Jacq
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“…Important progress in our present knowledge of interaction networks and of the interactome are essential to understand how gene functions and regulations are integrated at the level of an organism.”

Bernard Jacq (1950-2022)
Directeur de Recherches CNRS
A l’international, il fut celui qui en 1999, pensa et conceptualisa l’ensemble des interactions moléculaires et génétiques d’un organisme comme un réseau qui nous informerait sur le lien entre génotype et phénotype, donnant ainsi son nom à l’interactome et au champ thématique correspondant, l’interactomique.
Au niveau européen, il organisa avec le Pr Roland Rosset, la 11ème Conférence Européenne de Recherche sur la Drosophile, qu’il avait envisagé sur un bateau entre Marseille et la Corse, et qui finalement eu lieu du 5 au 8 septembre 1989 à Marseille-Luminy. En ce temps-là, organiser un tel congrès était un véritable tour de force; pas de mail, pas d’internet, au mieux un téléphone et/ou un Fax, les invitations se faisant par courrier postal!
Nationalement, membre du Conseil d’Administration de Sauvons la Recherche !, il oeuvra notamment dans les années 2005-2010, pour la liberté d’une recherche en biologie fondamentale débarrassée de tout impératif économique et pour le maintien de la biologie au sein du CNRS.
Localement, il initia l’enseignement de la bioinformatique à l’Université de la Méditerranée, en créant en 2000, avec quelques collègues, le DEA de Bioinformatique, Biologie Structurale et Génomique. Cette formation qui se poursuit aujourd’hui, a produit des dizaines d’actuels Directeurs, Chargés, Ingénieurs de Recherches et Maître de Conférences, qui font la bioinformatique d’aujourd’hui et l’enseignent partout en France et ailleurs.
Il était pour nous d’un soutien efficace et généreux, un aiguillon permanent (!), un collègue pionnier, fantasque, précieux et humainement engagé.
“… the total number of genes of an organism is less important than the complete repertoire of interactions potentially encoded by its genome (the interactome). Indeed, a small difference in the number of genes between two organisms could be sufficient to cause a large increase in the number of interactions (and hence a larger organizational complexity of the organism), provided that the ‘new’ genes code for proteins with a large potential. It is our belief that important progress in our present knowledge of interaction networks and of the interactome are essential to understand how gene functions and regulations are integrated at the level of an organism.”
Sanchez, Lachaize, Janody, Bellon, Röder, Euzenat, Rechenmann and Jacq (1999) Nucl. Acids Res. 27 :89-94.
Christine Brun, DR CNRS, TAGC Aix-Marseille Université – Inserm, Marseille
Laurence Röder, MCU AMU, TAGC Aix-Marseille Université – Inserm, Marseille
Laurent Fasano, DR CNRS, IBDM Aix-Marseille Université – CNRS, Marseille
Bulletin SFBI 2022 #1
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La SFBI est heureuse de vous présenter son premier bulletin d'information 2022. Vous recevrez chaque trimestre un mail de synthèse sur les principales nouvelles de la communauté SFBI, ainsi que les activités de la SFBI et actions en cours. En complément de ce mail, nous vous invitons à découvrir et lire les actualités sur le nouveau site de la SFBI et celles du site des Bioinfomations. Ce dernier site regroupe les articles des actualités de la SFBI, les Jeunes Bioinformaticiens de France, Bioinfo-fr.net, IFB et du GDR-BIM.
- Dernières nouvelles
- Activités de la SFBI (Fin 2021-1er trimestre 2022)
- La SFBI est membre du Collège des Sociétés Savantes de France (CoSSaF) afin de soutenir des actions communes
Depuis la réhabilitation du site web de la SFBI, 735 annonces ont été postées en 2021 et 115 de janvier à février 2022. Pour 2021, les annonces concernent :
- 330 offres de stage de niveaux BTS à M2 (les stages de M2 représentant la majorité des offres étudiantes (189), ainsi que 72 thèses, et 56 contrats d’apprentissage)
- 405 offres d’emploi dont 27.1% à durée indéterminée
- 9 bourses de voyages attribuées (7 doctorants et 2 post-doctorants) pour les journées du GDR-BIM et groupes de travail (MASIM, seqBIM et Bioss)
- Prix SFBI :
- Félicitations à Pradeep Eranti (UMRS 1124 / INSERM, Paris) pour de la meilleure présentation en bioinformatique à la conférence European Mathematical Genetic Meeting2021
- Félicitations aux 3 lauréats des meilleures présentations à JOBIM2021
- Lada Isakova, (IBENS / ENS, Paris)
- Laura Morel (Genphyse / INRAE, Toulouse)
- Camille Roquencourt (CEA, Saclay)
- Soutien de 4 JOBIM 2021 délocalisés : Lille, Bordeaux, Nice et Montpellier
- Un grand merci aux 17 équipes/laboratoires qui ont souscrit aux adhésions morales 2022 (IBISC, MAIAGE, LABGeM CEA Genoscope, Mesocentre UCA, IBENS UMR8197 DYOGEN, U900 Curie/INSERM/MINES ParisTech, SeBiMER, ABIMS, GeT-PlaGe, Institut Pasteur de la Guadeloupe, MathNum, GenHotel, PRABI-AMSB, ISEM-UM, URGI, BEBP, CNRG)
- Nomination d'un collège d'experts pour conseiller le bureau sur des actions politiques concernant la Société
- Actions en cours
- Appel à bourses de voyage 2022 ouvert (uniquement pour les adhérents SFBI)
- Appel à manifestations 2022 ouvert (uniquement pour les adhérents SFBI)
- Soutien et organisation des JOBIM finis, en cours et à venir !
- REBIF2022 - Recensement des formations en Bioinformatique en cours. N'hésitez à nous contacter si vous êtes ou connaissez le(s) responsable(s) de nouvelles formations
- Vulgarisation - Recensement des outils de vulgarisation de la bioinformation. Merci de nous contacter si vous souhaitez partager des outils avec la communauté.
- Site web toujours en évolution afin de fournir le maximum d'information à la communauté
- JOBIM2023 s'organise
- et d'autres nouveautés
Très bonne lecture !
Evènements en 2022
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Pour ce premier semestre 2022, quelques évènements sont programmés en ligne ou en présentiel, à vos calendriers.
MARS 2022
AVRIL 2022
MAI 2022
JUIN 2022
JUILLET 2022
SEPTEMBRE 2022
Soutien aux scientifiques et étudiant.e.s Ukrainien.ne.s
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Une fois n'est pas coutume, la SFBI souhaite vous informer de sujets qui ne sont pas strictement liés à la bioinformatique.
Tout d'abord, nous souhaitons vous informer que la SFBI apporte son soutien au peuple Ukrainien en ces temps de guerre.
Le collège des Sociétés Savantes Académiques de France a listé des initiatives pour aider les scientifiques étudiant.e.s Ukrainien.ne.s. Vous pouvez les retrouver en cliquant sur ce lien.

Bilan des offres d'emploi et stages 2021
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Pour l’année 2021, et à partir de la réouverture du site web de la SFBI avec notamment la possibilité de publier des offres d’emploi et stage (avril 2021), 735 annonces ont été postées:
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328 offres s’adressaient aux étudiants pour des stages de niveaux BTS à M2, les stages de M2 représentant la majorité des offres étudiantes (189), ainsi que 72 thèses, et 56 contrats d’apprentissage.

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405 offres d’emploi dont 27.1% à durée indéterminée. Ces offres s’adressaient aux candidats en ingénierie ( de AI à IR en passant par les autres postes en ingénierie du monde du privé) pour 64% des offres en contrat court, et pour 51% en contrat à durée indéterminé, 31.6% et 20.9% aux chercheurs et enseignant-chercheurs, et 3% et 27% aux autres postes.

On retrouve majoritairement des offres du domaine de l’analyse de données séquences génomiques et transcriptomiques mais également du domaine du machine learning et de la modélisation.

Dans les semaines qui viennent nous posterons sur le site de la SFBI un bilan plus détaillée des offres 2021, avec notamment une descriptions géographiques, et de niveau de salaire.
Pour 2022, à la date du 10 février, 115 offres ont déjà été mises en ligne sur le site de la SFBI.
Nous espérons que chaque offre a trouvé et trouvera un candidat. Bonne recherche à tous