Mots-Clés

analyse de données single-cell spatial transcriptomics analyse de données long-reads analyse génétique de cohorte de patients

Description

L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué d'un hôpital, et d'un Centre de Recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une forte représentativité internationale. L’objectif du Centre de Recherche de l’institut Curie est de développer la recherche fondamentale et d’utiliser les connaissances produites pour améliorer le diagnostic, le pronostic, la thérapeutique des cancers dans le cadre du continuum entre la recherche fondamentale et l’innovation au service du malade.

L'Institut Curie a aujourd'hui recours à des technologies de séquençage générant une quantité importante de données, et nécessitant des compétences et moyens bioinformatiques importants. Dans ce contexte, la plateforme de bioinformatique de l'Institut Curie, en étroite collaboration avec les équipes de l’Hôpital et du Centre de recherche, ouvre plusieurs postes visant à renforcer son expertise sur les thématiques innovantes ; analyse de données single-cell , spatial transcriptomics, analyse de données long-reads (Nanopore, PacBio), et analyse génétique de cohorte de patients (WES/RNA-seq).

Au sein de l'équipe d'analyse de données bioinformatiques et biostatistiques, l'ingénieur(e) participera :

• A la conduite de projets bioinformatiques de la définition aux résultats finaux,
• Aux analyses tertiaires des données en collaboration avec les différentes équipes de l'Institut Curie,
• A la définition des stratégies d'analyse des données,
• Au développement et à l'implémentation de nouvelles méthodologies si nécessaire,
• A un travail de veille technologique sur les dernières innovations technologiques et outils d'analyse bioinformatique et biostatistique,
• Au transfert de compétences auprès des autres ingénieurs de la plateforme et de l'Institut Curie,
• Aux formations en bioinformatique et biostatistique

Titulaire d’un diplôme d'ingénieur Grande Ecole, d’une thèse en biostatistique/bioinformatique, ou d’un Master 2 en bioinformatique avec une première expérience, vous disposez des compétences suivantes :

• Fort intérêt pour le domaine des sciences biologiques et/ou médicales,
• Maîtrise des concepts et outils biostatistiques et bioinformatiques, en particulier ceux utilisés en génomique et pour les analyses de données NGS
• Maîtrise de l'environnement Linux/Unix,
• Bonne connaissance des langages Python et R,
• Organisation et gestion de projet,
• Pratique courante de l'anglais écrit et oral.

Envoyer CV et lettre de motivation  à recrutement.U900-PF-BIOINFO@curie.fravec la référence BCSB_BA-2101