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Fouille d'interactions hôte-microbiome à l'aide de traitement automatique des langues

 CDD · Thèse  · 36 mois    Bac+5 / Master   Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes (LS2N) · Nantes (France)

 Date de prise de poste : 1 octobre 2021

Mots-Clés

Extraction de relations articles scientifiques biomédicaux microbiome humain traitement automatique des langues plongements de mots contextualisés

Description

### FR ###

Le sujet de thèse proposé porte sur l'extraction de relations entre espèces de microbiotes humains, et leurs relations avec des gènes, biomolécules, et maladies, à partir de la littérature scientifique, en utilisant des techniques de traitement automatique des langues. Nous nous intéresserons plus particulièrement aux articles traitant du microbiote intestinal et du microbiote pulmonaire, et nous validerons les résultats obtenus grâce à une collaboration étroite avec des chercheurs du CHU de Nantes travaillant sur ces deux microbiotes et leur rôle dans les maladies inflammatoires.


### EN ###
The proposed PhD thesis concerns the extraction of relations between human microbiota species, and their relationships with genes, biomolecules, and diseases, from scientific papers, using natural language processing techniques. We will focus on papers dealing with the gut microbiota and the lung microbiota, and we will validate the results obtained through a close collaboration with researchers from the University Hospital of Nantes working on these two microbiota and their role in inflammatory diseases.



Candidature

Procédure : Les candidatures doivent être envoyées par email à solen.quiniou@ls2n.fr et samuel.chaffron@ls2n.fr et doivent inclure : un CV détaillé, une lettre de motivation, vos notes de master 1 et master 2, ainsi qu’une ou deux lettres de recommandation (ou les adresses mails de personnes qui peuvent être contactées pour référence). Les candidatures peuvent être envoyées jusqu’au 26/04/2021.

Date limite : 26 avril 2021

Contacts

 Solen Quiniou et Samuel Chaffron

 saNOSPAMmuel.chaffron@univ-nantes.fr

 https://aiby4.ls2n.fr/2021/03/31/sujets-theses-2021/

Offre publiée le 12 avril 2021, affichage jusqu'au 17 mai 2021