Bio-informaticien·ne (Développeur·se web / Database designer)

 CDD · IE   Bac+3 / Licence   Unité de Recherche Clinique Paris Nord Val de Seine (URC PNVS) - DRCI - APHP · PARIS (France)

 Date de prise de poste : 3 mai 2021

Mots-Clés

développeur web php laravel recherche clinique, eCRF

Description

Poste de Développeur·se web / database designer (EDC designer) (bio-informaticien·ne senior)

Unité de Recherche Clinique Paris Nord Val de Seine (URC PNVS), Direction de la Recherche Clinique et de l’Innovation (DRCI), AP-HP (Assistance Publique – Hôpitaux de Paris)


Présentation de la structure :

L’unité de recherche clinique Paris Nord Val de Seine, URC PNVS, est dirigée par le Pr France Mentré. La responsable adjointe est le Dr Camille Couffignal et le Dr Cédric Laouénan est responsable de l’activité biométrie. L’URC PNVS gère les projets menés par les investigateurs des cinq sites (Beaujon - Clichy, 92 ; Bichat - Paris, 75 ; Bretonneau – Paris, 75 ; Louis-Mourier - Colombes, 92 ; EHPAD Adelaïde-Hautval – Villiers-le-Bel, 95) du groupe hospitalier universitaire AP-HP. Nord – Université de Paris.

Elle est constituée d’une équipe de plus de cinquante personnes parmi lesquelles : praticiens hospitaliers médecin ou pharmacien, chefs de projet, statisticiens, data-managers, bio-informaticiens, data scientists, attachés de recherche clinique, techniciens d’étude clinique.

L’URC PNVS a pour missions principales la mise en œuvre et le suivi des projets de recherche clinique portés par les investigateurs (médecins, pharmaciens, dentistes, sages-femmes ou paramédicaux) du groupe hospitalier HUPNVS dont l’AP-HP est promoteur. L’URC PNVS met à la disposition des investigateurs des compétences méthodologiques, statistiques et technico-réglementaire pour les aider à concevoir des projets de recherche et assurer leur accompagnement (méthodologie, biostatistiques, conformité, faisabilité, budgets prévisionnels, réponses aux appels d’offres). Représentante du promoteur, l’URC PNVS assure le suivi et le contrôle de la qualité des recherches, la gestion des données des projets et participe à la coordination des activités de recherche du groupe hospitalier.

L’URC est en relation très étroite avec le département d’épidémiologie, de biostatistiques et de recherche clinique (DEBRC) et apporte un soutien méthodologique à la recherche clinique sur le groupe hospitalier. Il est constitué d’un PU-PH, 2 MCU-PH, 2 PH, 3 AHU, 2 ingénieurs de recherche, d’internes (de pharmacie et de santé publique), et 1 secrétaire.

Deux autres structures sont également hébergées par le département : - la plateforme génomique du GH avec un ingénieur statisticien (analyses de données génétiques et omiques) ; - le centre de méthodologie de REACTing (REsearch and ACTion targeting emerging infectious diseases) de l’ITMO I3M d’AVIESAN (préparation de la recherche en période d’inter-épidémique et méthodologie, mise en place et analyses d’essais clinique en période d’épidémie de maladies infectieuses émergentes). Dans le cadre de nos missions via REACTing, le département est grandement impliqué dans plusieurs essais sur l’infection par le SARS-CoV-2. Nous assurons notamment la méthodologie, la gestion et les analyses de la cohorte nationale INSERM des patients infectés par le SARS-CoV-2 (FRENCH COVID), des cohortes nationales INSERM sur l’excrétion virale chez les sujets contacts considérés à risque élevé/modéré d’infection par le SARS-CoV-2 (COV-CONTACT et COV-CONTACT-SERO), de l’essai thérapeutique randomisée européen sur l’efficacité et de la sécurité des traitements des patients adultes hospitalisés pour une infection COVID-19 (DISCOVERY) et de l’essai thérapeutique randomisé AP-HP sur l’efficacité de la dexamethasone et de l’oxygénothérapie en réanimation (COVIDICUS).


Liaisons hiérarchiques directes

Samira LARIBI, manager de l’équipe Bio-informatique et EDC design de l’URC PNVS

Cédric LAOUÉNAN, responsable de l’équipe Biométrie de l’URC PNVS


Liaisons fonctionnelles :

  • Équipes de l’URC PNVS : bio-informaticien·nes et EDC (Electronic Data Capture) designers, attaché·es de recherche clinique (ARC), data managers, data scientist, statisticien·nes, méthodologistes, chef·fes de projets, technicien·nes d’étude clinique (TEC)
  • Médecins investigateur·rices des projets de recherche clinique
  • Centre d'investigation clinique, module épidémiologie clinique (CIC-EC 1425 Inserm), Hôpital Bichat
  • Direction de la Recherche Clinique et de l’Innovation (Siège), Hôpital Saint Louis
  • Département d’Épidémiologie Biostatistique et Recherche clinique (DEBRC), Hôpital Bichat
  • Centres Investigateurs (investigateur·rices, pharmacien·nes, biologistes, TEC)
  • AGEPS, le cas échéant.


Missions proposées :

  • Mettre en place et assurer la gestion des interfaces web et eCRF :
    • Analyser les besoins des projets de recherche et étudier la faisabilité technique pour le recueil des données électroniques.
    • Participer à la conception de maquettes de l’interface avant programmation.
    • Organiser et participer aux réunions avec les équipes projet.
    • Mettre en place des plannings prévisionnels de développement.
    • Développer, maintenir et mettre à jour des eCRF et des interfaces logicielles (applications web).
    • Organiser les phases de vérifications en interaction avec les différents acteurs des projets.
    • Rédiger des documents de suivi de programmation, de vérifications et de validation, des release notes, des guides utilisateurs.
    • Assurer un support utilisateurs (CleanWEB, REDCap, applications web) : répondre aux demandes, gérer les comptes.
  • Participer à la gestion du parc informatique et assurer la maintenance des logiciels sur les serveurs de l’APHP.
  • Rédiger, actualiser et mettre en œuvre les procédures et documents techniques spécifiques.


Compétences professionnelles souhaitées :

  • Maîtrise du processus de conception et modélisation d’une solution informatique.
  • Maîtrise du développement web :
    • PHP, HTML/CSS, Javascript,
    • Laravel,
    • Git.
  • Conception, actualisation, optimisation d’une base de données.
  • Maîtrise de SQL et SGBD relationnels (MySQL, PostgreSQL).
  • Paramétrage des EDC (CleanWEB, REDCap).
  • Conception et rédaction d’une documentation technique.
  • Identification, analyse, priorisation et synthèse des informations.
  • Recherche, sélection, exploitation et capitalisation des informations liées à la veille dans son domaine.
  • Maîtrise de l’anglais professionnel.
  • Connaissance des méthodologies FAIR.


Qualités requises :

  • Qualités relationnelles et goût pour le travail en équipe
  • Communication : savoir rendre compte, organiser des réunions
  • Autonomie, rigueur, méthode
  • Sens de l’organisation et respect des délais
  • Gestion des priorités et adaptation aux contraintes
  • Bonne qualité rédactionnelle
  • Sens de l’initiative
  • Discrétion et respect de la confidentialité


Niveau requis :

Licence professionnelle / Master 2 informatique - Bio-informatique avec minimum 3 ans d’expérience.


Modalités pratiques :

  • CDD de 6 mois renouvelable avec possibilité de CDI selon profil et ancienneté – Poste disponible à partir de mai, à pourvoir en fonction des délais administratifs.
  • Adresse : URC PNVS, Hôpital Bichat, 46 rue Henri Huchard 75018 Paris

Candidature

Procédure : Merci d’envoyer par mail vos CV et lettre de motivation

Date limite : 31 mai 2021

Contacts

Samira LARIBI

 saNOSPAMmira.laribi@aphp.fr

Offre publiée le 13 avril 2021, affichage jusqu'au 31 mai 2021