Mots-Clés
bio-informatique, biologie, bio statistique
Description
Le laboratoire CRIBL (UMR CNRS 7276 – INSERM 1262 –
Université de Limoges)
Le laboratoire CRIBL (Contrôle de la
réponse Immune et Lymphoproliférations) fait partie de l’institut GEIST qui réunit l’ensemble des
équipes de recherche actives dans les domaines de la Biologie, Santé,
Chimie-Environnement à Limoges.
Se consacrant essentiellement à l’étude du lymphocyte B (sur ses versants
physiologiques et pathologiques), notre laboratoire CRIBL fait partie des
acteurs incontournables de l’immunologie en France. CRIBL met en œuvre les
technologies modernes de biologie moléculaire et cellulaire pour poser des
questions :
– Fondamentales :
physiologie de la cellule B normale régulant la production d’anticorps, étude
du remodelage génétique associé à la différenciation et à la maturation du
lymphocyte B, biologie de la lymphomagenèse B.
– Appliquées à
des problématiques de médecine expérimentale : réalisation de modèles
murins de pathologies immunitaires et onco-hématologiques, participation à
l’activité de recherche clinique (via le Centre National de Référence sur les
pathologies par dépôt d’immunoglobulines), mise en place de nouveaux outils
diagnostiques pour les lymphomes.
– Finalisées :
avec des approches visant à l’amélioration du diagnostic et du traitement de
pathologies tumorales ou dysimmunitaires.
https://www.unilim.fr/cribl/qui-sommes-nous/presentation/
Contexte
L’évolution des techniques de NGS
et des thématiques de CRIBL nous amène à utiliser communément les techniques
suivantes : ChIP-Seq, LAM-HTGTS, 3C-HTGTS, RNA-Seq, mutation ciblées, etc.
Les données générées par ces techniques OMICS nécessitent le recrutement d’un
ingénieur bio-informaticien qui réalisera les analyses et développera au besoin
de nouveaux outil, en lien avec la biologie des lymphocytes B.
Missions et activités principales
·
Collecter et réaliser le traitement de données
issues de la recherche menées par les équipes de CRIBL
·
Adapter les applications et outils aux besoins
du projet
·
Orienter et conseiller les utilisateurs pour la
mise en œuvre des méthodes d'études et d'interprétation des résultats
·
Maintien et évolution des outils déjà
développées par CRIBL (DeMiner (Martin et al JI, CSReport)
·
Gérer les demandes
·
Assurer une veille scientifique et technologique
·
Organiser le stockage des données
·
Participer à des réseaux professionnels
Profil requis, compétences
Connaissances :
·
Connaissances approfondies en analyse et traitement
des données et informatique
·
Connaissances générale en biologie
·
Maîtrise de l’anglais scientifique
Compétences
opérationnelles :
·
Traitement des données
·
Coordonner différents projets
·
Interactions indispensables avec l’ensemble des
interlocuteurs de CRIBL
·
Garantir la qualité et la pertinence des outils
d’analyse et des résultats
·
Maitrise des langages de programmation (R, Python,
…)
Compétences comportementales :
·
Sens critique
·
Sens de l’organisation
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Capacité à travailler en autonomie
Diplôme et formation
professionnelles
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Master en bio-informatique
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Domaine de formation souhaitée :
bio-informatique, biologie, bio statistique