Mots-Clés
Ingénieur en Bioinformatique
Single Cell
R, Python
marqueurs vasculaires et lymphatiques
Description
Inovarion est un centre de Recherche et d’Innovation créé en 2013. A l’interface entre recherche fondamentale et développement industriel, Inovarion apporte son savoir-faire et son expertise aux grands acteurs publics et privés des Sciences.
Devenu en 8 ans un acteur central de la Recherche et du Développement en France, Inovarion a pour mission principale de contribuer à l’avancée des connaissances scientifiques dans les Sciences du Vivant.
Votre mission principale sera de mener à bien des projets de recherche en participant à leur conception, conduite et réalisation. Vous aurez à définir, mettre en place et exécuter l'ensemble des techniques nécessaires à la réalisation expérimentale des projets de recherche qui vous seront confiés. Vous aurez aussi à traiter, analyser, interpréter les données et valider les résultats. Vous participerez à la diffusion et la valorisation des résultats des programmes de recherche réalisés par Inovarion.
Le premier projet, en région Midi Pyrénées, qui vous sera confié consistera à identifier de nouveaux marqueurs vasculaires et lymphatiques dans un contexte de remodelage du tissu adipeux par l’analyse des données issues de single-cell RNA sequencing.
Vous serez en charge des missions suivantes :
1/ Identifier de nouveaux marqueurs des vaisseaux lymphatiques dans un contexte d’obésité issus des données de single-cells RNA sequencing:
- Identification des sous-populations de cellules endothéliales lymphatiques
- Identification de nouveaux marqueurs des vaisseaux lymphatiques encomparaison avec les cellules endothéliales des vaisseaux sanguins
- Analyses des données issues de single-cell RNA sequencing déjà publiées
2/ Identification de l’expression différentielle de gènes au cours du lymphœdèmeavec une analyse single-cell RNA sequencing :
- Analyses des populations cellulaires et leur changement d’expression géniqueau cours du lymphœdème
- Identification des populations en relation avec les données déjà publiées.
Le poste est à pourvoir dès que possible.
Compétences requises:
o Single Cell
o RNA-seq
o Analyses de données
o Analyses de populations cellulaires
o Analyses des changements d'expression génique
o Langages de programmation : R, Python