Ingénieur en bio-informatique pour le développement de la plateforme MicroScope
CDD-OD · IE · 24 mois Bac+5 / Master Genoscope · Évry (France) En fonction du diplôme et de l'expérience
Date de prise de poste : 1 septembre 2021
Mots-Clés
génomique microbienne
Description
Description du poste
Localisé au CEA/Genoscope, un centre de recherche scientifique dédié à la génomique environnementale, le Laboratoire d’Analyses Bioinformatiques pour la Génomique et le Métabolisme (LABGeM, UMR8030, https://labgem.genoscope.cns.
Le domaine connaît plusieurs évolutions majeures: annotation de milliers de génomes, analyses métagénomiques et pangénomiques, données FAIR, etc. Ces évolutions posent des défis en matière de représentation des données, de calcul et de stockage. Dans ce contexte la plateforme MicroScope doit continuellement être améliorée : ajout de nouvelles fonctionnalités, amélioration des interfaces web, mise à niveau de logiciels, etc
Dans cet objectif, nous recherchons un ou une ingénieur bioinformaticien qui s’intégrera dans l’équipe de développement de la plateforme constituée d’ingénieurs informaticiens et bioinformaticiens.
Missions & activités
Mission: Participation aux développements et à l’évolution fonctionnelle de la plateforme MicroScope.
Activités:
- Développement de nouveaux pipelines et intégration dans la plateforme MicroScope: comparaison de solutions, évaluation de la pertinence biologique.
- Participation à des projets de recherche et de bioanalyse.
- Participation à l’encadrement de stagiaires et d’alternants.
Profil
Ingénieur bioinformatique (avec une composante développement) possédant des compétences dans les domaines suivants :
- Bioinformatique
- Environnement Linux (scripting)
- Programmation Web (PHP, JS, HTML, CSS), base SQL
- Bonnes connaissances en génomique. Des connaissances en microbiologie seraient appréciées.
Expérience souhaitée : première expérience si possible mais non indispensable.
Contrat
- Ingénieur CDD-OD CEA de 24 mois.
- Rémunération en fonction du diplôme et de l’expérience (grille CEA).
- Début dès que possible (idéalement avant septembre 2021).
Candidature
Pour postuler, merci de nous faire parvenir un CV ainsi qu’une lettre de motivation aux adresses suivantes : acalteau@genoscope.cns.fr, vallenet@genoscope.cns.fr.
Candidature
Procédure : Pour postuler, merci de nous faire parvenir un CV ainsi qu’une lettre de motivation aux adresses suivantes : acalteau@genoscope.cns.fr, vallenet@genoscope.cns.fr.
Date limite : None
Contacts
David Vallenet
vaNOSPAMllenet@genoscope.cns.fr
Offre publiée le 1 juin 2021, affichage jusqu'au 29 juillet 2021