Scientifique bioanalyste
CDI · Autre Bac+5 / Master Anses - laboratoire de Lyon · Lyon (France)
Date de prise de poste : 15 septembre 2021
Mots-Clés
antibiorésistance NGS phylogénie métagénomique
Description
Contexte - L’unité AVB est principalement centrée sur l’épidémiologie moléculaire conventionnelle et génomique de l’antibiorésistance (ABR) dans le secteur non humain (principalement animal), et dans une perspective One Health.
Missions - Participer au développement et à la mise en place des outils pour l’analyse des données bactériennes de séquençage total (assemblage, phylogénie, séquençage 16S, métagénomique, RNA-seq). Un appui technique aux autres unités du laboratoire de Lyon, dans le domaine de compétences de la bioanalyse sera aussi sollicité.
Compétences -
Maîtrise de l’environnement Linux
Maîtrise des outils liés au traitement des données NGS (assemblage, mapping, variant calling…)
Maîtrise des outils d’analyses phylogénomiques
Maitrise des pipelines principaux pour l’analyse des données issues de bactéries
Maîtrise de R
Capacité d’analyse et de synthèse, rigueur
Candidature
Procédure : Adresser les candidatures par courriel (cv + lettre de motivation + formulaire de mobilité interne) en indiquant la référence 2021-081 à : recrutement@anses.fr
Date limite : 28 juin 2021
Contacts
Jean-Yves Madec
jeNOSPAMan-yves.madec@anses.fr
Offre publiée le 9 juin 2021, affichage jusqu'au 28 juin 2021