Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

Documentation FAIR Open Science Santé publique

Description

Contexte

L’UMS France Cohortes vise à apporter des services mutualisés aux cohortes épidémiologiques sur les aspects réglementaires, de système d’information, et sur les outils, méthodes et standards adéquats de production, de diffusion et d’exploitation de données. Dans une démarche de science ouverte, les données produites doivent suivre les recommandations FAIR, et en particulier faire l’objet d’une documentation permettant la meilleure traçabilité, et la meilleure information auprès des utilisateurs potentiels pour valoriser au mieux les données, dans le respect de l’intégrité scientifique des études en santé publique. Cette démarche s’inscrit également dans un projet européen TEHDAS visant à faire des recommandations de bonnes pratiques en la matière.

Mission

Au sein de l’UMS, vous aurez pour rôle principal d’animer et d’accompagner les structures dans le périmètre de France Cohortes afin de mettre en place une stratégie structurante de documentation des données conformément aux standards existants. L’objectif global est d’adopter des outils et des bonnes pratiques conformes avec les principes FAIR et les besoins dans le domaine de l’épidémiologie, en particulier pour permettre à l’utilisateur final de limiter le risque d’exploitation et d’interprétation erronée des données. Votre mission s’exerce, sous la responsabilité du directeur d’unité, au sein du pôle exploitation statistique de l’UMS.

Activités principales

• Mettre en place une démarche d’évaluation des systèmes de documentation retenus, en évaluer la pertinence au regard d’une grille de besoins d’utilisateurs potentiels,
• Faire des propositions de standards optimaux au regard des initiatives et standards et outils internationaux existants
• Animer des ateliers avec les cohortes participantes et accompagner l’appropriation de nouvelles pratiques et de nouveaux outils.
• Evaluer les moyens nécessaires pour faire évoluer les documentations de chaque cohorte participante vers la cible retenue et les accompagner dans cette démarche,
• Mettre en place une offre de formation à la documentation des données en direction des équipes de production et d’exploitation des données des cohortes,
• Participer à élaborer des recommandations sur les standards européens de documentation des données pour une exploitation en épidémiologie dans le cadre du projet TEHDAS.

Connaissances

• Maitrise de l'utilisation des métadonnées et de leur représentation : formats, normes et standards adaptés à la production, à l’exploitation, au stockage et à la diffusion des données scientifiques
• Maîtrise des langages et schémas RDF, XML et/ou Json
• Maitrise des identifiants pérennes des objets
• Maîtrise des outils statistiques et méthodes épidémiologiques d'analyses de données volumineuses et hétérogènes

Savoir-faire

• Coordination de projet et management transversal d’un réseau de compétences,
• Rédaction de documentation technique et méthodologique (rapport, article scientifique),
• Capacité à travailler en anglais indispensable

Aptitudes

• Aisance relationnelle, sens de la communication et de la pédagogie
• Capacités d’organisation, de planification et de rigueur
• Discrétion et confidentialité
• Capacité à fédérer et à convaincre
• Capacité d’adaptation et de curiosité

Expérience souhaitée

Une expérience dans le domaine de la gestion et la documentation de données en épidémiologie serait appréciée

Diplôme(s) souhaité(s)

Formation supérieure de type doctorat en science des données ou grande école