Mots-Clés

développement d'application, base de données, interface WEB, WEB semantic

Description

Description du poste: 

L'équipe SIGENAE, composée de 7 ingénieurs/es, met à disposition des laboratoires de l'INRAE travaillant sur la génomique des animaux d'élevage des outils et des services de bio-informatique. Ses travaux sont principalement centrés sur l'assemblage et l'annotation de séquences, l'analyse d'expression, la recherche de polymorphismes et la gestion des génotypages.

Le projet ANR EFFICACE, sur lequel interviendra l'ingénieur/e, cherche à améliorer l’efficience et la durabilité des systèmes de production d’œufs en allongeant les carrières de production des poules, ainsi que de comprendre certains mécanismes moléculaires impliquant des régulateurs de l’expression des gènes. Ce projet est coordonné par S. Lagarrigue, Institut Agro, unité PEGASE à Rennes. La personne recrutée sera en interaction régulière avec les membres de cette équipe. Le·a bio-informaticien·ne recruté·e sur ce projet, sera impliqué·e dans le développement d’un système de gestion des fichiers d’analyses et d’une interface facilitant leur interrogation et leur traitement.

Il·elle développera :

• les scripts d’intégration des données,
• l’interface d’interrogation,
• les chaînes des traitement standards produisant les résultats et mettant à jour les méta-données.
• Les utilitaires de validation et de nettoyage de la base.

Ce système a vocation à être étendu pour être utilisé par d’autres projets et de manière pérenne par les équipes de recherche associées.

Les compétences souhaitées : 

• maîtrise de l’environnement Unix/Li
• maîtrise d'un des langages de programmation Python ou Perl 
• expérience dans le développement d’interface WEB et de bases données

Capacités personnelles: 

• Diplôme minimum souhaité : BAC +3 info/ bio-informatique 
• Bon sens de l’organisation, rigueur, méthode et motivation 
• Envie de travailler en équipe

Contact : Les candidatures (CV + lettre de motivation) doivent être envoyées avant le 8 septembre 2021.