Mots-Clés

bioinformatique pipeline Plateforme

Description

L'institut Mondor de Recherche Biomedicale (IMRB) est une unité mixte de recherche UPEC (Univ. Paris-Est Créteil) / INSERM située sur le site Henri Mondor (http://www.inserm.imrb.fr)

La plateforme de bio-informatique offre des prestations aux équipes, principalement dans les domaines de la transcriptomique, mais aussi de la métagénomique et/ou l'analyse de données. Ces prestations incluent soit des analyses classiques mais également la mise en place de pipelines dédiés si besoin.

Les pipelines sont déployés et executés sur un cluster de calcul (environnement Unix/SLURM ; conda).

Un poste d'ingénieur d'étude (CDD) est a pourvoir pour aider :

1. suivi des contrôles qualités pour le RNASeq.

2. prendre en charge/aider aux prestations (RNAseq, métagénomique, etc.)

3. assistance aux utilisateurs.

Les compétences requises sont  :

- connaissance de l'environnement Unix et d'un langage (Python, R)

- connaissance en biostastiques/analyse de données

- connaissance d'un environnement de cluster de calcul serait un plus.

- anglais

- autonomie.

Rénumération : grille UPEC des ingénieurs en fonction de l'expérience.