Mots-Clés

Génomique bactérienne, Bio-informatique, Base de données, Analyses génomiques

Description

        L'augmentation constante du nombre de séquences génomiques complètes a engendré une approche puissante pour explorer la biologie des différents groupes de taxons, celle de la génomique comparative. Pour exploiter tout le potentiel de cette discipline, il faut développer des bases de données et des outils de calcul permettant d’établir des comparaisons significatives de vastes collections de génomes. Nous souhaiterions développer un nouveau système informatique comprenant l’ensemble des génomes des bactéries séquencées par l'IHU-Méditerranée Infection ainsi que les génomes collectés à partir d'archives de données de séquences publiques. Ce système fournirait des données intégrées et des outils d'analyse permettant la comparaison des génomes de différents isolats. Ce serait une ressource bioinformatique précieuse à partir de laquelle les biologistes pourraient tenter d'élucider la fonction des gènes prédits afin de comprendre leur implication dans le phénotype bactérien et leur contribution à l'émergence de la maladie et à la résistance thérapeutique.