Mots-Clés

single cell NGS bioinformatique Analyse Neuroscience Recherche Biostatistique

Description

Ingénieur(e)s en bio-informatique   / Bioinformatician

Contexte

La plateforme Data Analysis Core de l'ICM cherche à étendre ses offres d'analyse. Pour ce faire nous cherchons à recruter un ou plusieurs Ingénieur(e)s en bio-informatique pour renforcer notre équipe.

La plateforme de gestion et d’analyse des données de recherche en Neuroscience (DAC) a pour mission d’améliorer la collecte, le stockage, la gestion et l’analyse de l’ensemble des données médicales et scientifiques de l'Institut. L’équipe est constituée d’une quinzaine de personnes de spécialités variées et complémentaires : biostatisticien(ne)s, bioinformaticien(ne)s, data managers, et développeur(se)s.

Missions

Dans le cadre de son développement, la plateforme DAC recrute un(e) ingénieur(e) spécialisé(e) dans l’analyse de données single-cell et spatial transcriptomics.

Vous participerez à l'analyse et à l'interprétation des données omiques neuro focalisées.

Votre travail consistera à :

• Développer de nouvelles méthodes pour l’analyse de données « single-cell »
  

• Accompagner les chercheurs dans leur projet et aider à l’interprétation des données. Pour commencer, vous serez en étroite collaboration avec une équipe de l’ICM (Equipe d’Eric Leguern et Stéphanie Baulac) travaillant sur les syndromes épileptiques monogéniques.
  

• Assurer des sessions de formations autour de l’analyse de données « single cell » ou d’autres types de données omiques.

Votre profil :

• Expertise dans l’analyse de données « single cell »
  

• Compétences dans la construction de pipelines d’analyse de données de séquençage à haut débit
  

• Expertise en analyse de données génomiques humaines et animales
  

• Maîtrise des environnements UNIX (shell), de la programmation (notamment langages de scripts et R)
  

• Expérience professionnelle souhaitée d’au moins un an dans le domaine
  

• Diplômes : Bac+5 (master ou ingénieur) en bio-informatique, ou niveau équivalent en biologie/informatique complété par une expérience professionnelle dans l’autre domaine

Techniquement :

• Pratique experte d’au moins une méthode d’analyse de NGS
  

• Autonomie pour apprendre rapidement de nouvelles méthodes adaptées à la grande variété des données

Et aussi :

• Bonne maîtrise de l’anglais scientifique ;
• Capacité d’intégration au sein d’une équipe multi-disciplinaire, et aussi de communication avec des chercheurs venant d’horizons scientifiques variés ;
• Motivation pour les projets complexes et pour faire avancer la recherche en Neurosciences ! 

Conditions :

• Contrat CDD 24 mois ;
• Rémunération : en fonction du niveau d’étude et de l’expérience ;`
• Lieu d’exercice : ICM, Hôpital Pitié-Salpêtrière, 75013 PARIS.

Merci d’envoyer votre CV et lettre de motivation (en anglais) en indiquant les noms et contacts de deux personnes de référence (tout dossier incomplet ne sera pas pris en compte), à : lars.jorgensen@icm-institute.org en indiquant « Ingénieur(e)s en bio-informatique   / Bioinformatician » dans l’objet.

L’Institut du Cerveau est une Fondation Reconnue d’utilité publique, dont l’objet est la recherche fondamentale et clinique sur le système nerveux. Sur un même lieu, 650 chercheurs, ingénieurs et médecins couvrent l’ensemble des disciplines de la neurologie, dans le but d’accélérer les découvertes sur le fonctionnement du cerveau, et les développements de traitements sur des maladies comme Alzheimer, Parkinson, Sclérose en plaques, épilepsie, dépression, paraplégies, tétraplégies, etc