Mots-Clés

Intégration de données Site web Bases de données (MySQL)

Description

Description des équipes :

Les besoins en biologie computationnelle et des systèmes sont très importants dans l’UFR des sciences biomédicales et fondamentales (Campus Saint Germain) de l’Université de Paris. Ces besoins sont particulièrement critiques dans le champ de la toxicologie systémique. L’unité Inserm T3S (https://t3s-1124.biomedicale.parisdescartes.fr/ ) héberge un groupe de toxicologie systémique SysTox dirigé par le Dr Karine Audouze (https://systox.u-paris-sciences.fr/).

Ce groupe SysTox coordonne, ou est impliqué dans plusieurs projets et consortiums (ANR dont un en tant que coordinateur, …) ainsi que dans plusieurs projets européens H2020 dont OBERON (coordinateur), HBM4EU, HERA et RadoNorm. Outre ses propres activités, ce groupe SysTox répond dans la mesure du possible aux besoins exprimés par les autres équipes de l’unité et à travers des collaborations internationales. Ce groupe comprend à l’heure actuelle une MCU, un post-doctorant, trois doctorants et deux ingénieurs en CDD.

L’objectif du poste d’ingénieur sera de participer à des projets inter-équipes au sein de l’unité. La mission sera de fournir un soutien à des projets définis, en utilisant des techniques de biologie computationnelle et plus particulièrement dans le champ de la toxicologie. Des compétences en développement de site web et création de bases de données sous MySQL (ou équivalent) sont fortement attendus.

Le poste sera localisé au sein de l’unité T3S du Campus Saint Germain, dans le groupe SysTox.

profil recherchÉ

Compétences et aptitudes professionnelles requises

Connaissances :

- Excellentes maitrise en programmation, minimum R et python, des connaissances d’autres langages seraient un plus
- Excellentes connaissances en biologie computationnelle et bioinformatique, développement de site web, développement de bases de données.

- Avoir des connaissances générales en biologie/biochimie, et idéalement avoir des notions en toxicologie
- Anglais niveau B2 à C2 (CECR)

Savoir-faire :

- Programmer, installer les outils nécessaires sur les machines
- Maitriser les outils/logiciels de biologie computationnelle
- S’adapter aux besoins spécifiques des projets de recherche
- Savoir réaliser une analyse d’étude (fouille de données, préparation et intégration des données, analyses statistiques, interprétation, rapport des résultats et échange avec les autres chercheurs non bioinformaticiens)

Savoir-être :

- Travailler en équipe (y compris à distance)
- Organiser son travail pour une reproductibilité des analyses
- Savoir communiquer avec des chercheurs non-bioinformaticiens