Mots-Clés

génomique, statistique, biologie computationnelle des systèmes

Description

MISSIONS

Sous l’autorité hiérarchique de la responsable administrative et financière de l’UFR SFA et sous l’autorité fonctionnelle de la directrice du laboratoire GEHNOTEL, l’agent.e aura pour mission de contribuer à la mise en œuvre d’outils nécessaires aux traitements bio-informatiques et statistiques de données. Le laboratoire GenHotel-EA3886 de l’Université d’Evry Val d’Essonne est un laboratoire de recherche spécialisé dans la caractérisation de facteurs génomiques ainsi que dans l’analyse de réseaux biologiques de maladies complexes auto-immunes. Ses locaux sont situés dans le bâtiment G2 de l’Institut de Génomique (CEA/DSV). L’activité de l’agent.e s’exerce au sein du laboratoire GenHotel-EA3886, dont les locaux sont situés 2 rue Gaston Crémieux 91057 Evry Cedex), unité de recherche rattachée à l’UFR Sciences Fondamentales et Appliquées de l’Université d’Evry Val d’Essonne.

ACTIVITÉS Activités principales (liste non limitative) :

- Contribuer au développement des approches systémiques computationnelles pour la modélisation et la simulation de maladies complexes

- Elaborer des pipelines bio-informatiques pour l’analyse et l’intégration de données génomiques et données d’expression

- Favoriser le développement concerté d'outils et leur mise à disposition à l'ensemble du laboratoire

- Contribuer au maintien de l’infrastructure informatique du laboratoire

- Développements d'outils dans le cloud IFB

- Organiser la veille scientifique et technologique

-Former les membres du laboratoire aux principes et à la mise en œuvre d’outils développés en interne ou nouvellement utilisés par la communauté scientifique

- Diffuser et valoriser les résultats sous forme de rapports techniques et/ou de présentations orales

- Etre le contact entre la Direction des Systèmes d’Information (DISI) et le laboratoire

COMPÉTENCES Connaissance, savoir :

- Connaissances théoriques générales dans le domaine des sciences de la vie, tels que la biologie intégrative, génomique humaine, biologie des systèmes

- Connaissance pratique de logiciels appropriés aux analyses des données -omiques, et/ou d'outils de cartographie, et/ou de logiciels d’analyse de réseaux et de modélisation computationnelle

- Connaissance théorique et pratique en programmation et statistique (langages R, bash, python et/ou équivalents)

- Connaissance de la déontologie, de l'éthique, de la loi et de la réglementation concernant le domaine de recherche (en particulier sur la confidentialité, sécurité informatique, sauvegarde et protection des données) Savoir-faire :

- Motiver ses choix techniques auprès des responsables de projets

- Travailler en interaction à la fois avec des biologistes et des bio-informaticiens

- Maîtriser les différents environnements OS, comme Mac, Windows, UNIX

- Gérer les situations d'urgences et hiérarchiser les priorités

- Maîtriser l'anglais à l'oral et à l'écrit

Savoir être : Autonomie Capacité à travailler en équipe