Mots-Clés

analyse d'images biostatistique multi-omique

Description

L'équipe Mitolab concentre ses travaux sur l'étude des maladies mitochondriales. De nombreuses données d’imagerie microscopique (fluorescente à déconvolution et super résolution dSTORM) et d’analyses « omiques » (métabolomique) sont générés à partir de prélèvements, cultures cellulaires et modèles spécifiques. Les analyses apportent des résultats importants en pré-clinique et mettent en évidence des marqueurs biologiques. Les recherches fondamentales et les approches thérapeutiques sont développées autour du métabolisme mitochondrial. http://mitovasc.univ-angers.fr/en/index.html

Mission 1 : Développer des recherches méthodologiques en informatique, statistique et modélisation

Activité 1 : Développer les boites à outils logiciels nécessaires à la réalisation de l’analyse pour la microscopie de fluorescence à déconvolution

Activité 2 : Définir une stratégie de traitement et d’analyse des données morphologiques quantitatives pour la microscopie de super résolution

Mission 2 : Analyser des données de recherches expérimentales

Analyse de données Multi-omiques (métabolomique), développement des script (R, Python), participer au traitement et à l’analyse, génération d’analyses statistiques uni- (ANOVA, tests t, Mann-Whitney,…) et multi-variées (classification, ACP, PLS, OPLS, PLS-DA).

Savoirs :

• Connaissance en microscopie
• Biologie : méthodologie appliquée (connaissance générale)

Savoirs faire :

Utiliser en expert(e) les logiciels dédiés au traitement et à l’analyse d’images (Matlab, Imaris, Fiji,Huygens)

Maîtriser les langages de programmation Python, MATLAB, Java, C/C++

Expérience ou formation avancée en Machine Learning : Apprentissage supervisé, classification, CNN

Savoirs être :

• Goût du travail en équipe
• savoir communiquer, faire preuve de disponibilité et d’écoute
• Capacité de raisonnement analytique
• Créativité et sens de l’innovation