Deep Learning et génome
Stage · Stage M2
· 6 mois
Bac+5 / Master
INRAE - Unité GABI - Equipe BIGE · JOUY-EN-JOSAS (France)
Environ 500 €/mois + carte Navigo
Date de prise de poste : 1 mars 2022
Mots-Clés
Data science
IA
Deep learning
réseau de neurones
machine learning
génétique
génomique
Description
Objectif du projet :
L’objectif du stage est d’apprendre des réseaux de neurones prédisant le phénotype d’individus à partir de
leurs données génomiques. Afin de réduire la dimension des données de génotypage (50K SNP), nous nous
intéresserons en particulier aux méthodes d’apprentissage profond et de représentation des données (Word2Vec) afin d’extraire
des caractéristiques pertinentes pour la prédiction des phénotypes.
Une première expérience en programmation sur Tensorflow - Keras ou Pytorch est nécessaire; des notions de génétiques seront utiles.
Projet intersdiciplinaire avec des possibilités de thèses ultérieurment.
Offre publiée le 20 janvier 2022, affichage jusqu'au 30 avril 2022