Deep Learning et génome

 Stage · Stage M2  · 6 mois    Bac+5 / Master   INRAE - Unité GABI - Equipe BIGE · JOUY-EN-JOSAS (France)  Environ 500 €/mois + carte Navigo

 Date de prise de poste : 1 mars 2022

Mots-Clés

Data science IA Deep learning réseau de neurones machine learning génétique génomique

Description

Objectif du projet :

L’objectif du stage est d’apprendre des réseaux de neurones prédisant le phénotype d’individus à partir de

leurs données génomiques. Afin de réduire la dimension des données de génotypage (50K SNP), nous nous

intéresserons en particulier aux méthodes d’apprentissage profond et de représentation des données (Word2Vec) afin d’extraire

des caractéristiques pertinentes pour la prédiction des phénotypes.

Une première expérience en programmation sur Tensorflow - Keras ou Pytorch est nécessaire; des notions de génétiques seront utiles. 

Projet intersdiciplinaire avec des possibilités de thèses ultérieurment. 

Candidature

Procédure : Envoyez CV et lettre de motivation

Date limite : 30 avril 2022

Contacts

Eric Barrey

 erNOSPAMic.barrey@inrae.fr

 https://www6.jouy.inrae.fr/gabi/content/download/4643/57709/version/1/file/Offre-Stage_M2-DL-GenIA-BIGE-IBISC_v3-3.pdf

Offre publiée le 20 janvier 2022, affichage jusqu'au 30 avril 2022