Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

Bases de données, chemo-informatique, toxicologie prédictive, machine learning, scripts

Description

DESCRIPTION DU POSTE :
1- Bio/Chimio-informatique
-  Gère et améliore de manière continue les scripts
-  Réalise des parsages de bases de données afin d’enrichir en annotations la base de données du projet
-  Participe à la génération de modèles QSAR et aux analyses statistiques associées
-  Participe au développement de nouvelles solutions
-  Apporte son expertise en chimie/biologie à l’équipe
2- Gestion des données
-  Fait des mises à jour régulières des bases de données
-  Participe à la récupération de bases de données en fonction des besoins évolutifs dans le cadre de l'offre Safety by Design qui a trait à la toxicologie prédictive in silico
-  Réalise des sauvegardes de données
-  Effectue des mises à jour de la documentation relative aux scripts, aux méthodes et procédés développés
3- Travail d’Equipe
-  Interagit avec les autres membres de l’équipe de manière régulière
-  Organise son travail en fonction des priorités
-  Reporte au directeur scientifique

COMPETENCES REQUISES :
- Connaissance solide en biologie et chimie
- Algorithmes de type Machine Learning : GLM, Random Forest, KNN, Decision Tree, Neural Network
- Connaissance des formats sdf, smiles, mol2 ; connaissance des outils ChemAxon et RDKit
- Familiarité avec un système unix/linux et le langage bash
- Programmeur (c/c++/java/autre apprécié)
- Connaissance en php
- Langage de script (perl/python)
- Maîtrise du Sql