Ingénieur-e biologiste en analyse de données

 CDD · IR  · 12 mois (renouvelable)    Bac+8 / Doctorat, Grandes Écoles   IGBMC CERBM GIE · ILLKIRCH (France)

Mots-Clés

analyse données machinelearning randomforest neuralnetwork projets R&D tests fonctionnels biostatitisques C++ R Python Pearl

Description

En cohérence avec les orientations définies par la direction, vous pilotez et assurez la mise en œuvre des projets bio-informatiques de l’Institut Clinique de la Souris, centre leader des infrastructures Nationales PHENOMIN et CELPHEDIA. Vous intégrerez une équipe de 2-3 personnes.

En tant que bio informaticien, vous concevrez et définirez l’architecture des bases de données, et conduirez des projets de R&D pour l’analyse de données physiologiques et comportementales. Vous pourrez utiliser des modèles linéaires généralisés ou des techniques d’intelligence artificielle (Machine Learning, random forest, neural network) pour faciliter l’analyse de tests fonctionnels. Vous mettrez en œuvre des stratégies pour l’intégration des données générées par de multiples sources et techniques. Vous travaillerez avec des scientifiques ayant des connaissances en biostatistique et en biologie expérimentale pour développer de nouveaux pipelines du prétraitement à l'analyse des données précliniques en utilisant ces approches et dirigerez la mise en œuvre de ces pipelines dans des projets collaboratifs ICS.

 

ACTIVITES PRINCIPALES

  • Analyser et formaliser les besoins utilisateurs en analyse bio-informatique multiparamétriques
  • Concevoir et définir une architecture technique et fonctionnelle du système d’information,
  • Rédiger les spécifications techniques liées au système d'information
  • Réaliser tout ou partie d’un développement logiciel

ACTIVITES ASSOCIEES

  • Diriger le déploiement des applications
  • Diriger la mise en place de nouveaux pipelines analytiques pour les données physiologiques et comportementales et l'intégration des données
  • Former les utilisateurs

CONNAISSANCES

  • Connaissance des différentes architectures des systèmes d'information
  • Connaissance des outils d'IA et mise en œuvre dans les données biologiques
  • Connaissance approfondie des techniques de programmation objet et des applications distribuées
  • Connaissance en anglais

COMPETENCES OPERATIONNELLES

  • Compétences en informatique au moins dans un langage de programmation C++, R, Python ou Perl.
  • Compétences en gestion de bases données et analyse de données

COMPETENCES COMPORTEMENTALES

  • Bonne communication écrite et orale en anglais
  • Ouverture d’esprit, curiosité
  • Capacité d’écoute, esprit d’équipe
  • Esprit de synthèse
  • Rigueur

 

CONDITIONS PARTICULIERES D'EXERCICE

Vous intégrerez une équipe de 2-3 personnes et vous serez conduit à interagir avec d’autres centres en France, et à l’étranger (Europe, USA).

LIEU D'EXERCICE

Institut Clinique de la Souris.

Candidature

Procédure : Envoyer CV + lettre de motivation à Solène Schmitt (untereis@igbmc.fr).

Date limite : None

Contacts

Solène Schmitt

 unNOSPAMtereis@igbmc.fr

Offre publiée le 25 février 2022, affichage jusqu'au 25 mai 2022