Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

software, data analytics, web application

Description

Nous recherchons un développeur talentueux et motivé pour contribuer au développement d'un logiciel analytique et à son déploiement auprès d'une communauté de scientifiques. Ce projet s'inscrit dans le cadre d'une collaboration continue entre l'Institut Necker (INEM) et l'Institut Pasteur. Le logiciel existant est une suite analytique permettant un éventail de prétraitement des données, un contrôle de qualité automatique ou manuel, des tests d'association avancés utilisant un algorithme de régression récemment développé, et des fonctions de visualisation des résultats. Il vise l'analyse de grandes données de santé multidimensionnelles, y compris par exemple les données générées par la prochaine génération de séquençage à haut débit. La version actuelle du logiciel est écrit en java et JavaScript, il utilise spring-boot du côté serveur et Angular 8 pour le front-end, et il est actuellement déployé sur une instance AWS EC2. Le logiciel est opérationnel mais présente quelques limitations. L'objectif du projet est de remédier à ces limitations pour permettre une utilisation avancée à une communauté pouvant compter jusqu'à plusieurs centaines d'utilisateurs. Le projet implique des collaborations avec des experts en sciences de la santé, notamment des cliniciens, des épidémiologistes, des microbiologistes, des statisticiens et des informaticiens.