Mots-Clés

maladie auto-immunes, auto-anticorps, extraction de connaissances, graphe de connaissances, traitement automatique des langues, fouille de données, bases de données de santé

Description

La considération combinée des connaissances de l’état de l’art (la littérature scientifique, les bases de données biologiques expertes, etc.) et les entrepôts de données cliniques doivent permettre de structurer, puis d’enrichir les connaissances actuelles sur les maladies auto-immunes (MAI). En particulier nous proposons :

- extraction et analyse des connaissances de l’état de l’art à partir de la littérature et des bases de données expertes (notamment PubMed, OrphaNet, HPO, IGMT),

- extraction et analyse des données des entrepôts de données de santé pour valider les connaissances extraites de la littérature et les compléter par de nouvelles (EDS, BNDMR),

- construire et publier deux ressources de référence de façon ouverte et FAIR : un thésaurus des auto-anticorps, et une cartographie sous forme de graphes de connaissances qui relient pathologies auto-immunes, signes cliniques observés et présence d’auto-anticorps,

- comparaison entre les connaissances d’origines diverses.