Revenir à la liste des offres d'emplois Ingénieur(e) en bioinformatique CDD · IE · 12 mois (renouvelable) Bac+5 / Master Faculté de Médecine et de Pharmacie - Université de Bourgogne Franche-Comté · Besançon (France) Grille de la fonction publique tenant compte de l'expérience Date de prise de poste : 1 septembre 2022 Mots-Clés NGS biologie médicale santé microbiologie Description Définition de la fonction Ingénieur de recherche sur la plateforme Bioinformatique et Big data au Service de la Santé (2B2S; https://2b2s.univ-fcomte.fr/) Champ des relations Cf. Règlement intérieur de la plateforme 2B2S - Directeur de la plateforme - Autres ingénieurs du comité technique - Comité de pilotage scientifique – directeur(rice)s des équipes partenaires - Equipe informatique de l’UFR Santé - Stagiaires de la plateforme Missions et Activités Mission 1 Traitement des données de NGS en biologie médicale Activités : - Analyse de données de NGS en biologie (traitements des données brutes, stockage, alignement, assemblage) - Analyse des microbiotes humains et environnementaux - Analyse des données de RNAseq, de ChIP-Seq - Analyse de données de protéomique - Appel de variants chez les procaryotes et les eucaryotes (bactéries, parasites, champignons, virus, cellules cancéreuses) - Association des données biologiques et des données patients. Mission 2 Développement et montage de projets en lien avec les biologistes Activités : - Développement de nouveaux outils et pipelines d’analyses de données de NGS répondant aux besoins des équipes partenaires - Participation au montage des projets biologiques (notamment sur les besoins en données et les techniques nécessaires) Mission 3 Formation et suivi Activités : - Encadrement de stagiaires master 2, doctorants et post-doctorants (max. 2/an) - Administration d’un serveur sous linux Compétences nécessaires - Maîtrise de plusieurs outils de programmation - Maîtrise de l’anglais - Solides notions en biologie - Connaissance en administration linux - Connaissance en analyse statistique Qualités requises - Autonomie - Travail en groupe - Forte capacité d'initiative - Curiosité - Sens de l'organisation - Sens de la communication Candidature Procédure : Envoyer un mail à dhocquet@chu-besancon.fr Date limite : 15 juillet 2022 Contacts Didier Hocquet dhNOSPAMocquet@chu-besancon.fr https://2b2s.univ-fcomte.fr/ Offre publiée le 16 juin 2022, affichage jusqu'au 15 juillet 2022