Mots-Clés

NGS, bioinformatics, transcriptomics, epigenomics

Description

Un poste d'ingénieur en bioinformatique et biostatistiques pour l'analyse des données à haut-débit est
ouvert au Centre de Recherche de l'Institut Curie (http://www.curie.fr) à Paris. Le candidat travaillera au sein
de la plate-forme bioinformatique de l'unité U900 de Bioinformatique et Biologie des Systèmes du Cancer
(U900 INSERM - Mines ParisTech - Institut Curie, http://u900.curie.fr).

Contexte :
L'Institut Curie est un acteur majeur dans le traitement et la recherche contre le Cancer. Composé à la fois
d’un Hôpital et d’un Centre de Recherche, l'expertise de l'Institut Curie s'étend de la recherche fondamentale
au soin du patient. L’objectif du Centre de Recherche de l’Institut Curie est de développer la recherche
fondamentale et d’utiliser ces connaissances pour améliorer le diagnostic, le pronostic, le traitement des
cancers dans le cadre du continuum entre la recherche fondamentale et l’innovation au service du malade.
L'unité U900 compte près de 80 ingénieurs, chercheurs et étudiants en bioinformatique, biostatistiques et
biologie des systèmes (mathématiciens, statisticiens, bioinformaticiens, informaticiens, biologistes,
physiciens, médecins et bioanalystes).

Mission :
L'Institut Curie a aujourd'hui recours à des technologies de séquençage générant une quantité importante de
données, et nécessitant des compétences et moyens bioinformatiques importants. La plateforme de
bioinformatique de l'Institut Curie, en étroite collaboration avec les équipes de l’Hôpital et du Centre de
recherche, à pour mission d’apporter une expertise de pointe sur de nombreuses applications (épigénétique,
single-cell, médecine de précision, statistiques, etc.).
Dans ce contexte, nous cherchons à renforcer notre équipe en bioinformatique dans le but de continuer à
améliorer nos développements et à les appliquer à divers projets de recherche.
L'ingénieur(e) recruté(e) participera notamment :
- à la définition des stratégies et des bonnes pratiques d'analyse des données (veille, tests, implémentation)
- au développement et à la mise en place des chaînes de traitement d'analyses
- aux analyses tertiaires des données en collaboration avec les équipes du centre de recherche et de
l'hôpital.
Il sera impliqué dans les projets de recherche et/ou dans des projets cliniques utilisant les séquenceurs haut
débit (Illumina, PacBio, Nanopore) pour des analyses de type exome-seq, RNA-seq, methylation, etc.

Profil recherché :
Titulaire d’un diplôme d'ingénieur en biostatistique ou bioinformatique ou d’une thèse, vous disposez des
compétences suivantes :
- Motivation à apprendre, goût du travail en équipe, intérêt pour le domaine des sciences biologiques et médicales.
- Maîtrise des concepts et outils bioinformatiques, en particulier ceux utilisés en génomique et pour les
analyses de données NGS.
- Maîtrise de l'environnement Linux/Unix.
- Bonne connaissance des langages R, python, bash
- Avoir un bon niveau d'anglais écrit et oral
- Avoir un bon sens relationnel, organisé, et consciencieux