Mots-Clés

Bioinformatique Développement web RShiny Cancer

Description

L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est composé d'un Groupe Hospitalier et d'un Centre de Recherche de plus de 1500 salariés avec une forte représentativité internationale. 
L'objectif du Centre de Recherche est de développer la recherche fondamentale et d'utiliser les connaissances produites pour améliorer le diagnostic, le pronostic et la thérapeutique des cancers dans le cadre du continuum entre recherche fondamentale et innovation au service du patient. 
L’Institut Curie est centre de référence pour le rétinoblastome (tous les patients en France atteints de ce cancer sont traités et suivis à l’Institut Curie). 
 

Equipe Oncologie Moléculaire, UMR144 CNRS 

L’équipe Oncologie Moléculaire est une équipe pluridisciplinaire comprenant des biologistes, des bioinformaticiens et des médecins travaillant sur la progression tumorale dans un cancer fréquent de l’adulte, le cancer de vessie, et un cancer de l’enfant, le rétinoblastome. Les travaux sur les cancers de vessie s’inscrivent dans plusieurs collaborations déjà établies de longue date avec des équipes de médecins et épidémiologistes, ceux sur le rétinoblastome sont réalisées en collaboration avec les différences services de l’hôpital Curie qui est le centre de référence en France pour cette pathologie. Un groupe travaillant sur les cancers du pancréas et des voies biliaires a récemment rejoint l'équipe. Les hypothèses générées par l’analyse des données à large échelle sur ces différents cancers (données génétiques et épigénétiques) sont ensuite validées par des approches expérimentales. Les travaux de l’équipe s’inscrivent à la fois dans le domaine de la recherche fondamentale sur les cancers et dans le domaine de la recherche appliquée. 

L’équipe Oncologie Moléculaire est labellisée par La Ligue Nationale Contre le Cancer. 

Le travail proposé sera réalisé en collaboration étroite avec d’autres équipes et plateformes (bioinformatique, séquençage, …) du centre de recherche de l’Institut Curie des différents sites (Paris, Orsay et Saint-Cloud) mais également avec des collaborateurs extérieurs dans un contexte pluridisciplinaire. 

Description du poste 

Le candidat interagira avec les différents membres de l’équipe, les collaborateurs au sein de l’Institut Curie et les collaborateurs extérieurs. Il assurera le data management, la mise en place d’outils informatiques existants et le développement d’outils si nécessaire. 

Missions 

• Mise en place et développement d’applications et d’outils bioinformatiques pour la gestion, le traitement et la visualisation des données avec gestion et maintenance de la machine les hébergeant.  

• Mises à jour et maintenance des outils déjà existants. 

• Centralisation des informations sur les données générées par l’équipe  

• Récupération de données publiques utiles pour les analyses. 

• Réalisation d’analyses bioinformatiques ponctuelles 

• Mise en forme des données en vue de leur publication sur des banques de données dans le cadre d’articles scientifiques. 

• WebRéférent pour l’équipe 

Contraintes 

• Le poste sera principalement basé à l’institut Curie sur le site de Paris et à partir de 2024 sur le site de St-Cloud. 

Profil du candidat 

• Formation et expérience requises 

• Titulaire d’un master en bioinformatique ou informatique 

• Expérience professionnelle souhaitée 

• Compétences requises 

• Connaissances en développement informatique indispensables : MySQL, développement web, R, RShiny. 

• Environnement Linux. 

• Connaissances en analyses de données biologiques basiques 

• Être organisé(e) et rigoureux(se) 

• Capacité à travailler de manière indépendante tout en ayant un fort esprit d’équipe. 

• Être capable d’interagir dans un environnement pluridisciplinaire (biologie, médecine, bioinformatique) 

• Être capable de lire et de communiquer en anglais. 

Toutes nos offres sont ouvertes aux personnes handicapées 

Information sur le contrat 

• Type de poste : ingénieur d’étude 

• Type de contrat: Contrat à durée déterminée 

• Début souhaité:  Dès que possible 

• Durée: 18 mois, renouvelable 18 mois 

• Temps de travail: plein temps, 39 h par semaine, possibilité de télétravail jusqu’à 2 jours par semaine. 

• Rémunération: selon l’expérience et les grilles salariales de l’Institut Curie 

• Avantages : Restauration collective, remboursement des frais de transport à hauteur de 70 %, assurance maladie complémentaire. 

• Localisation du poste: Principalement à Curie Paris puis à partir de 2024 sur le site de St-Cloud. 

Contacts 

Envoyer votre CV et votre lettre de motivation à: francois.radvanyi@curie.fr, isabelle.Bernard-Pierrot@curie.fr, elodie.chapeaublanc@curie.fr 

date de publication de l’offre: juillet 2022 

fermeture de l’offre: septembre 2022