Société Française de Bioinformatique

Inovarion est un centre de Recherche et d’Innovation créé en 2013. A
l’interface entre recherche fondamentale et développement industriel,
Inovarion apporte son savoir-faire et son expertise aux grands acteurs
publics et privés des Sciences du Vivant.
Devenu en 9 ans un acteur central de la Recherche et du
Développement en France, Inovarion a pour mission principale de
contribuer à l’avancée des connaissances scientifiques dans les
Sciences du Vivant.

 

Votre mission principale sera de mener à bien des projets de recherche
en participant à leur conception, conduite et réalisation. Vous aurez à
définir, mettre en place et exécuter l'ensemble des techniques
nécessaires à la réalisation expérimentale des projets de recherche qui
vous seront confiés. Vous aurez aussi à traiter, analyser, interpréter les
données et valider les résultats. Vous participerez à la diffusion et la
valorisation des résultats des programmes de recherche réalisés par
Inovarion.

Le premier projet qui vous sera confié consistera à réaliser l'analyse et
l'intégration d’une large cohorte de données miRNA-seq provenant de
médulloblastomes, tumeurs pédiatriques cérébrales.

Le poste est à pourvoir à partir de septembre 2022 à Saint-Cloud.

Nous recherchons un candidat titulaire d'un Doctorat en
Bioinformatique et disposant de compétences en :

- Analyses Single Cell
- Gestion de Pipeline
- Analyses ATAC-seq
- Analyse RNA-seq
- Environnement Unix
- Maîtrise des outils d’analyses des données de séquençage
- Langage de programmation R
- Analyses Statistiques

Des Connaissance en génomique, biologie cellulaire et concept de
cancérologie sont désirables.
Une aisance dans la communication et représentation des résultats est
souhaitée.

L’activité confiée au scientifique pour ce projet inclut notamment :

- L’analyse d’une cohorte de 1000 échantillons miRNA-seq
- L'identification de miRNAs spécifiques des différents sous-types de
medulloblastome.
- L'analyse de Pathway
- L'intégration de données avec données RNA-seq, CNV et méthylation
de l’ADN avec entre autres l’utilisation de modèles de régressions
pénalisées
- L'identification des miRNAs ayant un rôle important dans la régulation
de la transcription dans différents sous-types de médulloblastome
- L'interprétation des résultats
- La production de figures pour publication

Nous recherchons avant tout une personne dynamique, rigoureuse,
méthodique, dotée d’un réel esprit d’équipe et d’une bonne capacité
d’organisation.