Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

grandes dimensions immunologie transcriptomique génomique cytométrie non supervisé machine learning

Description

Le candidat sera intégré parmi les équipes de recherche, les laboratoires de recherche technologiques et les différents acteurs liés à l’informatique et la bioinformatique du département IDMIT. Il sera amené à travailler sur différents projets de recherche et devra utiliser son expertise en mathématique et en informatique pour l’analyse de données expérimentales et répondre aux questions posées et aux problématiques émergentes. Il sera nécessaire d’avoir une bonne autonomie et suffisamment de connaissances en biologie/immunologie pour échanger avec les chercheurs et comprendre rapidement leurs problématiques.

Compétences souhaitées :

Nous recherchons un candidat avec une formation solide en informatique/mathématique, appliquée au domaine biomédical/santé.

• Analyse et intégration de données biologiques de grande dimension (ie. transcriptomique, génomique, cytométrique) grâce à différentes méthodes mathématiques/statistiques (PCA, SVD, MDS …)
• Maitrise d’outils d’analyse non supervisée de données cytométrique basée sur des algorithmes de clustering ou de réduction de dimension (SPADE, viSNE, UMAP), d’enrichissement fonctionnel (IPA, KEGG, EnrichR), de réseaux de co-expression/co-régulation de gènes.
• Machine-Learning
• Langages scientifiques (R, Python, LaTeX)
• Connaissances de base en biologie nécessaire, mais connaissances avancées en biologie et particulièrement en immunologie, et en biologie des systèmes serait un plus

Aptitudes :

• Capacité à communiquer à l’oral et à l’écrit en français et en anglais
• Attrait pour le travail d’équipe multidisplinaire
• Autonomie, rigueur, dynamisme, organisation, adaptabilité
• Anglais courant

Formation :

Master, PhD ou diplôme d’ingénieur avec 2 à 3 ans d’expérience
 

Salaire : grille CEA selon la formation et l’expérience