Société Française de Bioinformatique

Mots-Clés

single-cell,spatial,image,long-reads

Description

L'Institut Curie (http://www.curie.fr) recrute en bioinformatique/biostatistiques et analyse de données à haut-débit. En fonction des profils, les candidats seront détachés au sein de différentes équipes du Centre de Recherche et travailleront en étroite collaboration avec la plate-forme bioinformatique de l'unité U900 « Bioinformatique et Biologie des Systèmes du Cancer » (U900 INSERM - Mines ParisTech - Institut Curie) https://curie.fr/plateforme/curiecoretech-bioinformatique-cubic

Contexte :

L'Institut Curie est un acteur majeur dans le traitement et la recherche contre le Cancer. Composé à la fois d’un Hôpital et d’un Centre de Recherche, son expertise s'étend de la recherche fondamentale au soin du patient. L’objectif du Centre de Recherche est de développer la recherche fondamentale et translationnelle, et d’utiliser ces connaissances pour améliorer le diagnostic, le pronostic, et le traitement des cancers. Dans ce contexte, l’institut Curie s’appuie sur une environnement extrêmement dynamique, porté par des équipes de recherche et des plates-formes technologiques d’excellence. L'utilisation de la génomique et de l’imagerie en recherche et en clinique est en plein essor, s’appuyant notamment sur des avancées technologiques récentes. Ces évolutions étant rapides, les outils doivent en permanence évoluer afin de traiter les données de manière efficace et d'extraire les informations pertinentes pour répondre aux questions scientifiques posées.

La plate-forme de bioinformatique de l’institut Curie compte une 20aine d’ingénieurs et étudiants en informatique, bioinformatique et biostatistiques. Auxquels s’ajoute plusieurs ingénieurs/post-doctorants directement embarqués dans les équipes de recherche et travaillant à l’interface entre la plate-forme et les équipes de recherche.

Mission :

L'Institut Curie a aujourd'hui recours à des technologies générant une quantité importante de données, et nécessitant des compétences et moyens bioinformatiques importants. Dans ce contexte, nous cherchons à renforcer nos expertises sur les thématiques innovantes ;

• analyse de données single-cell RNA-seq et multi-omics

• spatial transcriptomics

• épigénètique

• analyse d’image

• analyse de données long-reads

Les candidats participeront :

• A la conduite de projets bioinformatiques de la définition aux résultats finaux,

• Aux analyses tertiaires des données sous la supervision de différentes équipes de recherche,

• A la définition des stratégies d'analyse des données,

• Au développement et à l'implémentation de nouvelles méthodologies si nécessaire,

• A un travail de veille technologique sur les dernières innovations technologiques et outils d'analyse bioinformatique et biostatistique,

• Au transfert de compétences auprès des autres ingénieurs de l'Institut Curie,

Profil recherché :

Titulaire d’un diplôme de Master2 en bioinformatique, d'ingénieur Grande Ecole ou d’une thèse en biostatistique/bioinformatique, vous êtes motivé et disposez des compétences suivantes :

• Fort intérêt pour le domaine des sciences biologiques et/ou médicales,

• Maîtrise des concepts et outils biostatistiques et bioinformatiques, en particulier ceux utilisés en génomique, analyse NGS, et/ou analyse d’image

• Maîtrise de l'environnement Linux/Unix,

• Bonne connaissance des langages Python et R,

• Bonne pratique de travail,

• Organisation et gestion de projet,

• Pratique courante de l'anglais écrit et oral.

• Excellent esprit d'équipe et sens relationnel

• Autonome, organisé, et consciencieux

Lieu de travail : Paris (5e)

Rémunération : Selon profil et expérience