Mots-Clés

R/Rmarkdown/Python Forge Base de données Stockage de données Requête API REST

Description

MetaboHUB (MTH) est l'infrastructure nationale française de métabolomique et de fluxomique. Lancée en 2013, MTH est une infrastructure internationale de premier plan au service de plus de 700 scientifiques dans le monde. MetaboHUB regroupe 5 installations nationales comprenant plus de 80 employés permanents, 15 RMN, 67 MS, des plateformes robotiques et informatiques. MTH a pour objectif de faire avancer le domaine de la métabolomique et de la fluxomique, de la cellule unique à la population. Votre contribution servira à un large éventail de chercheurs dans les domaines des biotechnologies, de la santé humaine, de la nutrition et des sciences végétales. En rejoignant MTH, vous serez impliqué dans une recherche de pointe au sein d'un consortium hautement qualifié et motivé.

La plateforme analytique MetaboHub-MetaToul-AXIOM est adossée à l’UMR INRAE TOXALIM, centre de recherches en toxicologie alimentaire de Toulouse. AXIOM développe des outils et méthodes pour l’étude du devenir et des effets des contaminants toxiques de l’alimentation sur la santé de l’animal et de l’Homme.

Toulouse Biotechnologiy Insitut (TBI), situé sur l’INSA de Toulouse, est un laboratoire à l’interface entre Sciences du vivant et Sciences pour l’ingénieur alliant recherche fondamentale, technologique et appliquée. Il est composé de 12 équipes de recherche et de cinq plateformes technologiques et plateaux dont MetaboHub-Metatoul-FluxoMet.

L’objectif est de mettre en place un outil informatique permettant la production d’un rapport de résultats standardisé pour l’ensemble des plateformes impliquées dans MTH 2.0. Pour cela, une solution logicielle sera développée afin de compiler les résultats expérimentaux, les définitions des matériels et méthodes et les données administratives du projet. Cet outil devra entre autres permettre :

• un accès facile via une interface graphique pour la rédaction

• un export dans différents types de fichier (PDF, HTML, Word)

• une collaboration pour la rédaction entre plusieurs plateformes

• un accès à une base de données

• une gestion des différentes versions générées

La personne recrutée aura pour objectif de développer un outil compatible avec les besoins des 5 plateformes régionales de MetaboHUB. Pour cela l’outil devra répondre au cahier des charges qui a été défini. Il/elle évoluera dans une infrastructure nationale impliquant plusieurs plateformes et devra avoir, par conséquent, l’esprit d’équipe, un bon contact relationnel ainsi qu’une forte curiosité scientifique et technique afin de toujours apporter des solutions innovantes au projet.