Mots-Clés

NGS pipeline d'analyse Nextflow annotation cluster de calcul

Description

Le/la collaborateur/collaboratrice recherché(e) aura pour rôle principal de développer et maintenir des pipeline d'analyse. Cela inclut le développement et le maintient des scripts et outils, mais également de l'infrastructure logicielle de calcul, et des bases de données associées. Il ou elle participera grâce à ses connaissances en bioinformatique à répondre à des questions de recherche variées, et sera capable d’implémenter des idées rapidement et de créer des chaines de traitement reproductibles.

•Réaliser l’acquisition et assurer la gestion et l’analyse de données provenant de séquenceurs de nouvelle génération (NGS) Illumina.

•Mettre en place des outils d’annotation et de sélection de variants.

•Mettre en place des outils bioinformatiques et les déployer sur un serveur.

•Participer à l’administration d’un cluster de calcul.•Participer au développement des différents pipeline d’analyse.

Toutes les informations et détails : http://www.good.cnrs.fr/2022/10/19/bioinformaticien%c2%b7ne-developeur%c2%b7euse/

Prise de fonction : Dès que possible