Bio-informaticien - projet OSIRIS H/F
CDD · Ingénieur autre · 12 mois Bac+5 / Master Institut Bergonié · Bordeaux (France) 37 423
Date de prise de poste : 1 novembre 2022
Mots-Clés
bio-informatique cancérologie oncogériatrie OSIRIS santé
Description
Mission principale :
Vous assurerez l’interopérabilité des données de plusieurs projets en vous appuyant sur le standard OSIRIS (INCa) développé pour structurer et standardiser les données en cancérologie. Vous conduirez le nettoyage, la transformation et la strandardisation des données (ETL, connecteurs) et vous développerez des outils autour d’OSIRIS et d’aspect d’analyse de données.
Activités générales :
- Assurer les activités de structuration, standardisation, ETL et connecteurs en phase avec le standard OSIRIS.
- Travailler sur une extension du modèle OSIRIS pour l’oncogériatrie.
- Créer des outils autour du standard OSIRIS.
- Rédiger la documentation liée aux activités et former les utilisateurs.
Activités spécifiques :
- Assurer la cohérence des traitements de données avec la réglementation.
- Corriger et compléter les données
- Interagir avec les biologistes et cliniciens en adéquation avec les besoins des projets.
- Travailler en équipe avec autres bio-informaticien de l’unité pour la bonne articulation des différents projets
Profil attendu :
- Ingénieur informatique (biologie/santé), Master bio-informatique ou informatique médicale, équivalent …
- Forte appétence pour la standardisation des données
- Intérêt pour l’analyse de données
- Connaissance en cancérologie
Compétences requises :
- Travail sous environnement linux
- Maitrise du langage Python
- Gestion de version Git
- Organisation, stockage de données
- Standard, UMLS, SIRIC OSIRIS, interopérabilité
- Autonomie et capacité d’apprentissage rapide
Atouts du poste :
- Accessibilité: transports en commun à proximité, places de parking, parking vélos sécurisé.
- Prise en charge de l’abonnement transport en commun à 60% ;
- Comité Social et Économique : chèques cadeaux, chèques rentrée scolaire, places de cinéma… ;
- Restauration collective sur place avec tarif préférentiel (3,26€) ;
Plage horaire :
- Lundi au vendredi
- 39h/ semaine
- 22 RTT + 25 congés payés
- Télétravail possible sous réserve de l’accord du supérieur hiérarchique
Rémunération
- Catégorie selon grille de rémunération des CLCC, 37,4 K€ bruts/an.
Candidature
Procédure : Les candidatures sont à adresser à : bergonie.recrutement@bordeaux.unicancer.fr
Date limite : 30 novembre 2022
Contacts
Service recrutement
beNOSPAMrgonie.recrutement@bordeaux.unicancer.fr
Offre publiée le 20 octobre 2022, affichage jusqu'au 30 novembre 2022