Mots-Clés
genomique fonctionelle, bioinformatique, epigenetique, transcriptome, genome editing
Description
Le CR2TI est une Unité Mixte de Recherche de l’Inserm et de Nantes Université basée sur le campus du CHU de Nantes et le bâtiment IRS2. Il est constitué de 6 équipes de recherche pour un total de 230 personnes (chercheurs, enseignants-chercheurs, cliniciens, étudiants, ingénieurs, techniciens) principalement dédiées au décryptage des mécanismes immunologiques et à l'amélioration du diagnostic et des traitements dans les domaines de la transplantation d’organes, des maladies inflammatoires, auto-immunes et des maladies infectieuses. Le recrutement se situe dans le cadre du consortium UPS-NDDecipher (financé par ANR) qui vise à caractériser un groupe de gènes associé au système ubiquitine protéasome impliqué dans les maladies rares neurodéveloppementaux. Le consortium utilise une approche translationnelle et intégrative, impliquant des technologies et des infrastructures de pointe, et combinant une expertise et des compétences englobant les domaines de la génétique clinique, de la biologie moléculaire, de l'ingénierie et de la culture des cellules souches pluripotentes induites par l'homme (hiPSC), de la neurogénétique, du cerveau imagerie, épigénétique et génomique fonctionnelle à haut débit. L’ingénieur.e de recherche sera impliqué.e dans le genome-editing des mutations dans des lignées hiPSC dérivées de patients ainsi que leur caractérisation au niveau moléculaire. Cette caractérisation sera effectuée par une approche multi-omique utilisant le transcriptome et l’épigénome (histone ChIP-seq, ATAC-seq) de ces lignées hiPSC ainsi qu’après leur différentiation en neurones.